/[MITgcm]/MITgcm/adjoint/makefile
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revision 1.16 by heimbach, Thu Sep 27 20:12:10 2001 UTC revision 1.16.4.17 by dimitri, Thu Feb 27 22:12:17 2003 UTC
# Line 2  SHELL           = /bin/tcsh Line 2  SHELL           = /bin/tcsh
2  RM               = rm -f  RM               = rm -f
3  LOC              = $(PWD)  LOC              = $(PWD)
4  TAMC             = tamc  TAMC             = tamc
5  TAF              = ~fastopt/bin/taf  ###TAMC             = /data43/ralf/tamc/tamc
6    TAF              = taf
7    ###TAF              = ~fastopt/bin/taf
8  DEST             = .  DEST             = .
9  SOURCE_CODE      = ../bin  SOURCE_CODE      = ../bin
10  ADJOINT_SCRIPT   = ../adjoint  ADJOINT_SCRIPT   = ../adjoint
11  BASE             = ..  BASE             = ..
12    TAMCFLAGS        = -reverse -i4 -r4
13    TAFFLAGS         = -reverse -i4 -r4 -nonew_arg
14  PKG             = $(BASE)/pkg  PKG             = $(BASE)/pkg
 ADTAMCFLAGS      = -reverse -i4 -r4 -admark  ad  
 ADTAFFLAGS       = -reverse -i4 -r4 -admark  ad  
 TLTAMCFLAGS      = -forward -i4 -r4 -ftlmark g_  
 TLTAFFLAGS       = -forward -i4 -r4 -ftlmark g_  
 # -warn_step -flow taf_flow.log  
15    
16  DIFF_FLAGS       = -toplevel the_main_loop              \  DIFF_FLAGS       = -toplevel the_main_loop              \
17                     -input  '    xx_theta_dummy          \                     -input  '    xx_theta_dummy          \
18                                  xx_salt_dummy           \                                  xx_salt_dummy           \
                                 xx_tr1_dummy            \  
19                                  xx_hflux_dummy          \                                  xx_hflux_dummy          \
20                                  xx_sflux_dummy          \                                  xx_sflux_dummy          \
21                                  xx_tauu_dummy           \                                  xx_tauu_dummy           \
22                                  xx_tauv_dummy           \                                  xx_tauv_dummy           \
23                                  xx_sss_dummy            \                                  xx_atemp_dummy          \
24                                  xx_sst_dummy            \                                  xx_aqh_dummy            \
25                                  xx_diffkr_dummy         \                                  xx_uwind_dummy          \
26                                  xx_kapgm_dummy'         \                                  xx_vwind_dummy          \
27                                    xx_obcsn_dummy          \
28                                    xx_obcss_dummy          \
29                                    xx_obcsw_dummy          \
30                                    xx_obcse_dummy'         \
31                     -output 'fc'                     -output 'fc'
32    
33  ADTAMCFLAG         = $(ADTAMCFLAGS) $(DIFF_FLAGS)  TAMCFLAG         = $(TAMCFLAGS) $(DIFF_FLAGS) -admark ad
34  ADTAFFLAG          = $(ADTAFFLAGS)  $(DIFF_FLAGS)  
35    TAFFLAG          = $(TAFFLAGS) $(DIFF_FLAGS) -admark ad
36    
 TLTAMCFLAG         = $(TLTAMCFLAGS) $(DIFF_FLAGS)  
 TLTAFFLAG          = $(TLTAFFLAGS)  $(DIFF_FLAGS)  
37    
38  # Source files for the MITgcmUV  # Source files for the MITgcmUV
39  SRC_MODEL       = \  SRC_MODEL       = \
40                  $(PKG)/autodiff/read_write.flow \                  $(PKG)/autodiff/read_write.flow \
41                  $(PKG)/autodiff/read_write_fld.flow     \                  $(PKG)/autodiff/read_write_fld.flow     \
42                  $(PKG)/autodiff/read_write_rec.flow     \                  $(PKG)/autodiff/read_write_rec.flow     \
                 $(PKG)/autodiff/diags.flow              \  
43                  $(PKG)/autodiff/cg2d.flow               \                  $(PKG)/autodiff/cg2d.flow               \
44                    $(PKG)/autodiff/diags.flow              \
45                  $(PKG)/autodiff/debug.flow              \                  $(PKG)/autodiff/debug.flow              \
46                  $(PKG)/autodiff/dummy_in_stepping.flow  \                  $(PKG)/autodiff/dummy_in_stepping.flow  \
47                  $(PKG)/autodiff/external_fields_load.flow       \                  $(PKG)/autodiff/external_fields_load.flow       \
# Line 56  SRC_MODEL      = \ Line 57  SRC_MODEL      = \
57                  $(PKG)/autodiff/initialisation.flow     \                  $(PKG)/autodiff/initialisation.flow     \
58                  $(PKG)/autodiff/mdsio.flow              \                  $(PKG)/autodiff/mdsio.flow              \
59                  $(PKG)/autodiff/monitor.flow            \                  $(PKG)/autodiff/monitor.flow            \
60                    $(PKG)/autodiff/obcs.flow               \
61                  $(PKG)/autodiff/checkpoint.flow         \                  $(PKG)/autodiff/checkpoint.flow         \
                 $(PKG)/autodiff/print_message.flow      \  
62                  $(PKG)/autodiff/open_copy_data_file.flow\                  $(PKG)/autodiff/open_copy_data_file.flow\
63                  $(PKG)/autodiff/timeave.flow            \                  $(PKG)/autodiff/timeave.flow            \
64                                                                  \                                                                  \
# Line 66  SRC_MODEL      = \ Line 67  SRC_MODEL      = \
67                  $(SOURCE_CODE)/calc_common_factors.f            \                  $(SOURCE_CODE)/calc_common_factors.f            \
68                  $(SOURCE_CODE)/calc_diffusivity.f               \                  $(SOURCE_CODE)/calc_diffusivity.f               \
69                  $(SOURCE_CODE)/calc_div_ghat.f                  \                  $(SOURCE_CODE)/calc_div_ghat.f                  \
70                    $(SOURCE_CODE)/calc_exact_eta.f                 \
71                  $(SOURCE_CODE)/calc_grad_phi_surf.f             \                  $(SOURCE_CODE)/calc_grad_phi_surf.f             \
72                  $(SOURCE_CODE)/calc_gs.f                        \                  $(SOURCE_CODE)/calc_gs.f                        \
73                  $(SOURCE_CODE)/calc_gt.f                        \                  $(SOURCE_CODE)/calc_gt.f                        \
# Line 73  SRC_MODEL      = \ Line 75  SRC_MODEL      = \
75                  $(SOURCE_CODE)/calc_ivdc.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/calc_ivdc.f                      \
76                  $(SOURCE_CODE)/calc_phi_hyd.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/calc_phi_hyd.f                   \
77                  $(SOURCE_CODE)/calc_viscosity.f                 \                  $(SOURCE_CODE)/calc_viscosity.f                 \
                 $(SOURCE_CODE)/comm_stats.f                     \  
78                  $(SOURCE_CODE)/convect.f                        \                  $(SOURCE_CODE)/convect.f                        \
79                  $(SOURCE_CODE)/convective_adjustment.f          \                  $(SOURCE_CODE)/convective_adjustment.f          \
80                  $(SOURCE_CODE)/convective_adjustment_ini.f      \                  $(SOURCE_CODE)/convective_adjustment_ini.f      \
# Line 87  SRC_MODEL      = \ Line 88  SRC_MODEL      = \
88                  $(SOURCE_CODE)/external_forcing_surf.f          \                  $(SOURCE_CODE)/external_forcing_surf.f          \
89                  $(SOURCE_CODE)/find_alpha.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/find_alpha.f                     \
90                  $(SOURCE_CODE)/find_rho.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/find_rho.f                       \
                 $(SOURCE_CODE)/forward_step.f                   \  
91                  $(SOURCE_CODE)/freeze.f                         \                  $(SOURCE_CODE)/freeze.f                         \
92                                                                  \                                                                  \
93                  $(SOURCE_CODE)/gad_advection.f                  \                  $(SOURCE_CODE)/gad_advection.f                  \
# Line 121  SRC_MODEL      = \ Line 121  SRC_MODEL      = \
121                                                                  \                                                                  \
122                  $(SOURCE_CODE)/grad_sigma.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/grad_sigma.f                     \
123                  $(SOURCE_CODE)/impldiff.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/impldiff.f                       \
124                    $(SOURCE_CODE)/ini_autodiff.f                   \
125                  $(SOURCE_CODE)/ini_cartesian_grid.f             \                  $(SOURCE_CODE)/ini_cartesian_grid.f             \
126                  $(SOURCE_CODE)/ini_cg2d.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_cg2d.f                       \
                 $(SOURCE_CODE)/ini_communication_patterns.f     \  
127                  $(SOURCE_CODE)/ini_cori.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_cori.f                       \
128                  $(SOURCE_CODE)/ini_curvilinear_grid.f           \                  $(SOURCE_CODE)/ini_curvilinear_grid.f           \
129                  $(SOURCE_CODE)/ini_depths.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/ini_depths.f                     \
# Line 135  SRC_MODEL      = \ Line 135  SRC_MODEL      = \
135                  $(SOURCE_CODE)/ini_mixing.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/ini_mixing.f                     \
136                  $(SOURCE_CODE)/ini_p_ground.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/ini_p_ground.f                   \
137                  $(SOURCE_CODE)/ini_pnh.f                        \                  $(SOURCE_CODE)/ini_pnh.f                        \
                 $(SOURCE_CODE)/ini_procs.f                      \  
138                  $(SOURCE_CODE)/ini_psurf.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/ini_psurf.f                      \
139                  $(SOURCE_CODE)/ini_salt.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_salt.f                       \
140                  $(SOURCE_CODE)/ini_spherical_polar_grid.f       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_spherical_polar_grid.f       \
# Line 160  SRC_MODEL      = \ Line 159  SRC_MODEL      = \
159                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_vu.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_vu.f                   \
160                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_wu.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_wu.f                   \
161                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_bottomdrag.f               \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_bottomdrag.f               \
162                    $(SOURCE_CODE)/mom_u_coriolis.f                 \
163                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_del2u.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_del2u.f                    \
164                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_nh.f                \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_nh.f                \
165                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_sphere.f            \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_sphere.f            \
# Line 171  SRC_MODEL      = \ Line 171  SRC_MODEL      = \
171                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_adv_vv.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_adv_vv.f                   \
172                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_adv_wv.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_adv_wv.f                   \
173                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_bottomdrag.f               \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_bottomdrag.f               \
174                    $(SOURCE_CODE)/mom_v_coriolis.f                 \
175                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_del2v.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_del2v.f                    \
176                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_metric_nh.f                \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_metric_nh.f                \
177                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_metric_sphere.f            \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_metric_sphere.f            \
# Line 198  SRC_MODEL      = \ Line 199  SRC_MODEL      = \
199                  $(SOURCE_CODE)/state_summary.f                  \                  $(SOURCE_CODE)/state_summary.f                  \
200                  $(SOURCE_CODE)/timestep.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/timestep.f                       \
201                  $(SOURCE_CODE)/the_correction_step.f            \                  $(SOURCE_CODE)/the_correction_step.f            \
                 $(SOURCE_CODE)/the_main_loop.f                  \  
202                  $(SOURCE_CODE)/thermodynamics.f                 \                  $(SOURCE_CODE)/thermodynamics.f                 \
203                  $(SOURCE_CODE)/timestep_tracer.f                \                  $(SOURCE_CODE)/timestep_tracer.f                \
204                  $(SOURCE_CODE)/swfrac.f                         \                  $(SOURCE_CODE)/swfrac.f                         \
# Line 215  SRC_MODEL      = \ Line 215  SRC_MODEL      = \
215                                                                  \                                                                  \
216                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_diff.f               \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_diff.f               \
217                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_tensor.f             \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_tensor.f             \
218                    $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_psi_b.f              \
219                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_diags.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_diags.f                   \
220                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_init.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_init.f                    \
221                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_rtransport.f              \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_rtransport.f              \
222                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_slope_limit.f             \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_slope_limit.f             \
223                    $(SOURCE_CODE)/gmredi_slope_psi.f               \
224                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_xtransport.f              \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_xtransport.f              \
225                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_ytransport.f              \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_ytransport.f              \
226                                                                  \                                                                  \
                 $(SOURCE_CODE)/ctrl_map_ini.f                   \  
                 $(SOURCE_CODE)/ctrl_map_forcing.f               \  
227                                                                  \                                                                  \
228                    $(SOURCE_CODE)/cost_aqh.f                       \
229                    $(SOURCE_CODE)/cost_argo_salt.f                 \
230                    $(SOURCE_CODE)/cost_argo_theta.f                \
231                    $(SOURCE_CODE)/cost_atemp.f                     \
232                    $(SOURCE_CODE)/cost_atlantic.f                  \
233                    $(SOURCE_CODE)/cost_averagesfields.f            \
234                    $(SOURCE_CODE)/cost_averagesfinal.f             \
235                    $(SOURCE_CODE)/cost_averagesflags.f             \
236                    $(SOURCE_CODE)/cost_averagesinit.f              \
237                    $(SOURCE_CODE)/cost_ctds.f                      \
238                    $(SOURCE_CODE)/cost_ctdt.f                      \
239                    $(SOURCE_CODE)/cost_drift.f                     \
240                    $(SOURCE_CODE)/cost_drifter.f                   \
241                    $(SOURCE_CODE)/cost_driftw.f                    \
242                  $(SOURCE_CODE)/cost_final.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/cost_final.f                     \
243                  $(SOURCE_CODE)/cost_init.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/cost_forcing.f                   \
244                  $(SOURCE_CODE)/cost_tile.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/cost_geoid.f                     \
245                  $(SOURCE_CODE)/cost_test.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/cost_heatflux.f                  \
246                  $(SOURCE_CODE)/cost_tracer.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/cost_hyd.f                       \
247                    $(SOURCE_CODE)/cost_initvaria.f                 \
248                    $(SOURCE_CODE)/cost_merstress.f                 \
249                    $(SOURCE_CODE)/cost_readers.f                   \
250                    $(SOURCE_CODE)/cost_readsssfields.f             \
251                    $(SOURCE_CODE)/cost_readsstfields.f             \
252                    $(SOURCE_CODE)/cost_readscatxfields.f           \
253                    $(SOURCE_CODE)/cost_readscatyfields.f           \
254                    $(SOURCE_CODE)/cost_readtopex.f                 \
255                    $(SOURCE_CODE)/cost_readtopexmean.f             \
256                    $(SOURCE_CODE)/cost_salt.f                      \
257                    $(SOURCE_CODE)/cost_salt0.f                     \
258                    $(SOURCE_CODE)/cost_saltflux.f                  \
259                    $(SOURCE_CODE)/cost_scat.f                      \
260                    $(SOURCE_CODE)/cost_ssh.f                       \
261                    $(SOURCE_CODE)/cost_ssh_mean.f                  \
262                    $(SOURCE_CODE)/cost_sss.f                       \
263                    $(SOURCE_CODE)/cost_sst.f                       \
264                    $(SOURCE_CODE)/cost_theta.f                     \
265                    $(SOURCE_CODE)/cost_theta0.f                    \
266                    $(SOURCE_CODE)/cost_uwind.f                     \
267                    $(SOURCE_CODE)/cost_vwind.f                     \
268                    $(SOURCE_CODE)/cost_xbt.f                       \
269                    $(SOURCE_CODE)/cost_zonstress.f                 \
270                    $(SOURCE_CODE)/cost_obcs.f                      \
271                    $(SOURCE_CODE)/cost_obcsn.f                     \
272                    $(SOURCE_CODE)/cost_obcss.f                     \
273                    $(SOURCE_CODE)/cost_obcsw.f                     \
274                    $(SOURCE_CODE)/cost_obcse.f                     \
275                    $(SOURCE_CODE)/cost_ice.f                       \
276                    $(SOURCE_CODE)/sw_ptmp.f                        \
277                    $(SOURCE_CODE)/sw_adtg.f                        \
278                                                                  \                                                                  \
279                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getheatflux.f               \
280                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getsaltflux.f               \
281                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getzonstress.f              \
282                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getmerstress.f              \
283                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getatemp.f                  \
284                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getaqh.f                    \
285                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getuwind.f                  \
286                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getvwind.f                  \
287                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getobcsn.f                  \
288                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getobcss.f                  \
289                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getobcsw.f                  \
290                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getobcse.f                  \
291                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getrec.f                    \
292                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_init_variables.f            \
293                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_map.f                       \
294                                                                    \
295                    $(SOURCE_CODE)/ecco_init.f                      \
296                    $(SOURCE_CODE)/ecco_the_main_loop.f             \
297                                                                    \
298                    $(SOURCE_CODE)/exf_init.f                       \
299                    $(SOURCE_CODE)/exf_init_runoff.f                \
300                    $(SOURCE_CODE)/exf_readparms.f                  \
301                    $(SOURCE_CODE)/exf_summary.f                    \
302                    $(SOURCE_CODE)/exf_bulkcdn.f                    \
303                    $(SOURCE_CODE)/exf_bulkqsat.f                   \
304                    $(SOURCE_CODE)/exf_bulkrhn.f                    \
305                    $(SOURCE_CODE)/exf_getffields.f                 \
306                    $(SOURCE_CODE)/exf_getffieldrec.f               \
307                    $(SOURCE_CODE)/exf_getforcing.f                 \
308                    $(SOURCE_CODE)/exf_mapfields.f                  \
309                    $(SOURCE_CODE)/exf_getobcs.f                    \
310                    $(SOURCE_CODE)/exf_getsurfacefluxes.f           \
311                    $(SOURCE_CODE)/exf_swapffields.f                \
312                    $(SOURCE_CODE)/exf_filter_rl.f                  \
313                    $(SOURCE_CODE)/exf_filter_rs.f                  \
314                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_aqh.f                    \
315                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_atemp.f                  \
316                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_evap.f                   \
317                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_hflux.f                  \
318                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_lwflux.f                 \
319                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_lwdown.f                 \
320                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_precip.f                 \
321                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_sflux.f                  \
322                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_swflux.f                 \
323                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_swdown.f                 \
324                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_ustress.f                \
325                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_uwind.f                  \
326                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_vstress.f                \
327                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_vwind.f                  \
328                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_obcs.f                   \
329                                                                    \
330                    $(SOURCE_CODE)/exf_clim_init.f                  \
331                    $(SOURCE_CODE)/exf_clim_readparms.f             \
332                    $(SOURCE_CODE)/exf_clim_summary.f               \
333                    $(SOURCE_CODE)/exf_getclim.f                    \
334                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_climsalt.f               \
335                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_climtemp.f               \
336                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_climsss.f                \
337                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_climsst.f                \
338                                                                    \
339                    $(SOURCE_CODE)/cal_addtime.f                    \
340                    $(SOURCE_CODE)/cal_checkdate.f                  \
341                    $(SOURCE_CODE)/cal_compdates.f                  \
342                    $(SOURCE_CODE)/cal_convdate.f                   \
343                    $(SOURCE_CODE)/cal_copydate.f                   \
344                    $(SOURCE_CODE)/cal_daysformonth.f               \
345                    $(SOURCE_CODE)/cal_dayspermonth.f               \
346                    $(SOURCE_CODE)/cal_fulldate.f                   \
347                    $(SOURCE_CODE)/cal_getdate.f                    \
348                    $(SOURCE_CODE)/cal_getmonthsrec.f               \
349                    $(SOURCE_CODE)/cal_intdays.f                    \
350                    $(SOURCE_CODE)/cal_intmonths.f                  \
351                    $(SOURCE_CODE)/cal_intsteps.f                   \
352                    $(SOURCE_CODE)/cal_intyears.f                   \
353                    $(SOURCE_CODE)/cal_isleap.f                     \
354                    $(SOURCE_CODE)/cal_monthsforyear.f              \
355                    $(SOURCE_CODE)/cal_monthsperyear.f              \
356                    $(SOURCE_CODE)/cal_nstepday.f                   \
357                    $(SOURCE_CODE)/cal_numints.f                    \
358                    $(SOURCE_CODE)/cal_printdate.f                  \
359                    $(SOURCE_CODE)/cal_printerror.f                 \
360                    $(SOURCE_CODE)/cal_stepsforday.f                \
361                    $(SOURCE_CODE)/cal_stepsperday.f                \
362                    $(SOURCE_CODE)/cal_subdates.f                   \
363                    $(SOURCE_CODE)/cal_timeinterval.f               \
364                    $(SOURCE_CODE)/cal_timepassed.f                 \
365                    $(SOURCE_CODE)/cal_timestamp.f                  \
366                    $(SOURCE_CODE)/cal_toseconds.f                  \
367                    $(SOURCE_CODE)/cal_weekday.f                    \
368                                                                    \
369                    $(SOURCE_CODE)/obcs_apply_sloc.f                \
370                    $(SOURCE_CODE)/obcs_apply_tloc.f                \
371                    $(SOURCE_CODE)/obcs_apply_ts.f                  \
372                    $(SOURCE_CODE)/obcs_apply_uv.f                  \
373                    $(SOURCE_CODE)/obcs_calc.f                      \
374                    $(SOURCE_CODE)/obcs_init_variables.f            \
375                    $(SOURCE_CODE)/obcs_sponge.f
376    
377    #               $(SOURCE_CODE)/adi.f                            \
378    #               $(SOURCE_CODE)/lsr.f                            \
379    #               $(SOURCE_CODE)/advect.f                         \
380    #               $(SOURCE_CODE)/budget.f                         \
381    #               $(SOURCE_CODE)/diffus.f                         \
382    #               $(SOURCE_CODE)/dynsolver.f                      \
383    #               $(SOURCE_CODE)/groatb.f                         \
384    #               $(SOURCE_CODE)/growth.f                         \
385    #               $(SOURCE_CODE)/ostres.f                         \
386    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_check.f                   \
387    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_do_diags.f                \
388    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_get_forcing.f             \
389    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_init.f                    \
390    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_model.f                   \
391    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_pickup.f                  \
392    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_readparms.f               \
393    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_exch.f
394    
395  #--------------------------------------------------------  #--------------------------------------------------------
396  # rules  # rules
397  #--------------------------------------------------------  #--------------------------------------------------------
398    
399  allcode:  small_f:
400          cd $(DEST) ; cat $(SRC_MODEL) >! tamc_code_ecco.f          cd $(SOURCE_CODE); $(MAKE) depend; $(MAKE) small_f
401    
402    adcode:
403            cd $(DEST) ; cat $(SRC_MODEL) >! tamc_code_ecco.f
404  admodeltamc:  admodeltamc:
405          cd $(DEST) ; $(TAMC) $(ADTAMCFLAG) tamc_code_ecco.f     \          cd $(DEST) ; $(TAMC) $(TAMCFLAG) tamc_code_ecco.f       \
406             >! tamc_code_ecco_ad.prot             >! tamc_code_ecco_ad.prot
407    
408  admodeltaf:  admodeltaf:
409          cd $(DEST) ; $(TAF) $(ADTAFFLAG) tamc_code_ecco.f          cd $(DEST) ; $(TAF) $(TAFFLAG) tamc_code_ecco.f
410    
411  tlmodeltamc:  adrestore:
412          cd $(DEST) ; $(TAMC) $(TLTAMCFLAG) tamc_code_ecco.f     \          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_template     \
413             >! tamc_code_ecco_tl.prot             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F
   
 tlmodeltaf:  
         cd $(DEST) ; $(TAF) $(TLTAFFLAG) tamc_code_ecco.f  
414    
415  adchange:  adchange:
416          ${ADJOINT_SCRIPT}/adjoint_ecco_sed.com \          ${ADJOINT_SCRIPT}/adjoint_ecco_sed.com          \
417             >! tamc_code_ecco_sed_ad.f ;  \             >! tamc_code_ecco_sed_ad.f ;                 \
418          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F              \          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F              \
419             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_old ;        \             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_old ;        \
         cat tamc_code_ecco_sed_ad.f >> $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F  
 adrestore:  
420          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_template     \          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_template     \
421             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F;             \
422            cat tamc_code_ecco_sed_ad.f >> $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F
 tltamc:  allcode tlmodeltamc  
   
 tltaf:  allcode tlmodeltaf  
423    
424  adtamc:  adrestore allcode admodeltamc  adtamc:  adrestore small_f adcode admodeltamc
425    
426  adtaf:  adrestore allcode admodeltaf  adtaf:  adrestore small_f adcode admodeltaf
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