/[MITgcm]/MITgcm/adjoint/makefile
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revision 1.16 by heimbach, Thu Sep 27 20:12:10 2001 UTC revision 1.16.4.31 by heimbach, Mon Aug 18 09:32:16 2003 UTC
# Line 2  SHELL           = /bin/tcsh Line 2  SHELL           = /bin/tcsh
2  RM               = rm -f  RM               = rm -f
3  LOC              = $(PWD)  LOC              = $(PWD)
4  TAMC             = tamc  TAMC             = tamc
5  TAF              = ~fastopt/bin/taf  ###TAMC             = /data43/ralf/tamc/tamc
6    TAF              = taf
7    ###TAF              = ~fastopt/bin/taf
8  DEST             = .  DEST             = .
9  SOURCE_CODE      = ../bin  SOURCE_CODE      = ../bin
10  ADJOINT_SCRIPT   = ../adjoint  ADJOINT_SCRIPT   = ../adjoint
11  BASE             = ..  BASE             = ..
12  PKG             = $(BASE)/pkg  PKG             = $(BASE)/pkg
13  ADTAMCFLAGS      = -reverse -i4 -r4 -admark  ad  #
14  ADTAFFLAGS       = -reverse -i4 -r4 -admark  ad  ADTAMCFLAGS      = -reverse -admark ad -i4 -r4
15  TLTAMCFLAGS      = -forward -i4 -r4 -ftlmark g_  ADTAFFLAGS       = -reverse -admark ad -i4 -r4 \
16  TLTAFFLAGS       = -forward -i4 -r4 -ftlmark g_                          -l taf_ad.log -flow taf_ad_flow.log -nonew_arg
17  # -warn_step -flow taf_flow.log  FTLTAMCFLAGS     = -forward -ftlmark g_ -i4 -r4
18    FTLTAFFLAGS      = -forward -ftlmark g_ -i4 -r4 \
19                            -l taf_ftl.log -flow taf_ftl_flow.log -nonew_arg
20    SVDTAMCFLAGS     = -reverse -forward -pure -i4 -r4
21    SVDTAFFLAGS      = -reverse -forward -pure -i4 -r4 \
22                            -flow taf_flow.log -nonew_arg
23    #
24    # further useful options: -warn_step -flow taf_flow.log
25    # NB: the svd option recommended in the TAMC manual doesn't work.
26    
27  DIFF_FLAGS       = -toplevel the_main_loop              \  DIFF_FLAGS       = -toplevel the_main_loop              \
28                     -input  '    xx_theta_dummy          \                     -input  '    xx_theta_dummy          \
# Line 22  DIFF_FLAGS       = -toplevel the_main_lo Line 32  DIFF_FLAGS       = -toplevel the_main_lo
32                                  xx_sflux_dummy          \                                  xx_sflux_dummy          \
33                                  xx_tauu_dummy           \                                  xx_tauu_dummy           \
34                                  xx_tauv_dummy           \                                  xx_tauv_dummy           \
35                                  xx_sss_dummy            \                                  xx_atemp_dummy          \
36                                  xx_sst_dummy            \                                  xx_aqh_dummy            \
37                                  xx_diffkr_dummy         \                                  xx_uwind_dummy          \
38                                  xx_kapgm_dummy'         \                                  xx_vwind_dummy          \
39                                    xx_obcsn_dummy          \
40                                    xx_obcss_dummy          \
41                                    xx_obcsw_dummy          \
42                                    xx_obcse_dummy          \
43                                    xx_sst_dummy            \
44                                    xx_sss_dummy            \
45                                    xx_diffkr_dummy         \
46                                    xx_kapgm_dummy          \
47                                    xx_efluxy_dummy         \
48                                    xx_efluxp_dummy'        \
49                     -output 'fc'                     -output 'fc'
50    
51  ADTAMCFLAG         = $(ADTAMCFLAGS) $(DIFF_FLAGS)  ADTAMCFLAG         = $(ADTAMCFLAGS) $(DIFF_FLAGS)
52  ADTAFFLAG          = $(ADTAFFLAGS)  $(DIFF_FLAGS)  ADTAFFLAG          = $(ADTAFFLAGS)  $(DIFF_FLAGS)
53    
54  TLTAMCFLAG         = $(TLTAMCFLAGS) $(DIFF_FLAGS)  FTLTAMCFLAG         = $(FTLTAMCFLAGS) $(DIFF_FLAGS)
55  TLTAFFLAG          = $(TLTAFFLAGS)  $(DIFF_FLAGS)  FTLTAFFLAG          = $(FTLTAFFLAGS)  $(DIFF_FLAGS)
56    
57    SVDTAMCFLAG         = $(SVDTAMCFLAGS) $(DIFF_FLAGS)
58    SVDTAFFLAG          = $(SVDTAFFLAGS)  $(DIFF_FLAGS)
59    
60  # Source files for the MITgcmUV  # Source files for the MITgcmUV
61  SRC_MODEL       = \  SRC_MODEL       = \
62                  $(PKG)/autodiff/read_write.flow \                  $(PKG)/autodiff/read_write.flow \
63                  $(PKG)/autodiff/read_write_fld.flow     \                  $(PKG)/autodiff/read_write_fld.flow     \
64                  $(PKG)/autodiff/read_write_rec.flow     \                  $(PKG)/autodiff/read_write_rec.flow     \
                 $(PKG)/autodiff/diags.flow              \  
65                  $(PKG)/autodiff/cg2d.flow               \                  $(PKG)/autodiff/cg2d.flow               \
66                    $(PKG)/autodiff/cost.flow               \
67                    $(PKG)/autodiff/diags.flow              \
68                  $(PKG)/autodiff/debug.flow              \                  $(PKG)/autodiff/debug.flow              \
69                    $(PKG)/autodiff/do_the_model_io.flow    \
70                  $(PKG)/autodiff/dummy_in_stepping.flow  \                  $(PKG)/autodiff/dummy_in_stepping.flow  \
                 $(PKG)/autodiff/external_fields_load.flow       \  
71                  $(PKG)/autodiff/eesupp.flow             \                  $(PKG)/autodiff/eesupp.flow             \
72                  $(PKG)/autodiff/active_file.flow        \                  $(PKG)/autodiff/active_file.flow        \
73                    $(PKG)/autodiff/active_file_loc.flow    \
74                  $(PKG)/autodiff/write_state.flow        \                  $(PKG)/autodiff/write_state.flow        \
75                  $(PKG)/autodiff/ecco_check_exp.flow     \                  $(PKG)/autodiff/ecco_check_exp.flow     \
76                  $(PKG)/autodiff/exch_ad.flow            \                  $(PKG)/autodiff/exch_ad.flow            \
# Line 56  SRC_MODEL      = \ Line 81  SRC_MODEL      = \
81                  $(PKG)/autodiff/initialisation.flow     \                  $(PKG)/autodiff/initialisation.flow     \
82                  $(PKG)/autodiff/mdsio.flow              \                  $(PKG)/autodiff/mdsio.flow              \
83                  $(PKG)/autodiff/monitor.flow            \                  $(PKG)/autodiff/monitor.flow            \
84                    $(PKG)/autodiff/obcs.flow               \
85                  $(PKG)/autodiff/checkpoint.flow         \                  $(PKG)/autodiff/checkpoint.flow         \
86                  $(PKG)/autodiff/print_message.flow      \                  $(PKG)/autodiff/print_message.flow      \
87                  $(PKG)/autodiff/open_copy_data_file.flow\                  $(PKG)/autodiff/open_copy_data_file.flow\
# Line 73  SRC_MODEL      = \ Line 99  SRC_MODEL      = \
99                  $(SOURCE_CODE)/calc_ivdc.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/calc_ivdc.f                      \
100                  $(SOURCE_CODE)/calc_phi_hyd.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/calc_phi_hyd.f                   \
101                  $(SOURCE_CODE)/calc_viscosity.f                 \                  $(SOURCE_CODE)/calc_viscosity.f                 \
                 $(SOURCE_CODE)/comm_stats.f                     \  
102                  $(SOURCE_CODE)/convect.f                        \                  $(SOURCE_CODE)/convect.f                        \
103                  $(SOURCE_CODE)/convective_adjustment.f          \                  $(SOURCE_CODE)/convective_adjustment.f          \
104                  $(SOURCE_CODE)/convective_adjustment_ini.f      \                  $(SOURCE_CODE)/convective_adjustment_ini.f      \
# Line 81  SRC_MODEL      = \ Line 106  SRC_MODEL      = \
106                  $(SOURCE_CODE)/cycle_tracer.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/cycle_tracer.f                   \
107                  $(SOURCE_CODE)/different_multiple.f             \                  $(SOURCE_CODE)/different_multiple.f             \
108                  $(SOURCE_CODE)/do_fields_blocking_exchanges.f   \                  $(SOURCE_CODE)/do_fields_blocking_exchanges.f   \
                 $(SOURCE_CODE)/do_the_model_io.f                \  
109                  $(SOURCE_CODE)/dynamics.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/dynamics.f                       \
110                  $(SOURCE_CODE)/external_forcing.f               \                  $(SOURCE_CODE)/external_forcing.f               \
111                  $(SOURCE_CODE)/external_forcing_surf.f          \                  $(SOURCE_CODE)/external_forcing_surf.f          \
112                  $(SOURCE_CODE)/find_alpha.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/find_alpha.f                     \
113                  $(SOURCE_CODE)/find_rho.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/find_rho.f                       \
                 $(SOURCE_CODE)/forward_step.f                   \  
114                  $(SOURCE_CODE)/freeze.f                         \                  $(SOURCE_CODE)/freeze.f                         \
115                                                                  \                                                                  \
116                    $(SOURCE_CODE)/calc_grad_phi_hyd.f              \
117                    $(SOURCE_CODE)/convective_weights.f             \
118                    $(SOURCE_CODE)/convectively_mixtracer.f         \
119                    $(SOURCE_CODE)/diags_phi_hyd.f                  \
120                    $(SOURCE_CODE)/diags_phi_rlow.f                 \
121                    $(SOURCE_CODE)/do_stagger_fields_exchanges.f    \
122                    $(SOURCE_CODE)/external_fields_load.f           \
123                    $(SOURCE_CODE)/integr_continuity.f              \
124                                                                    \
125                  $(SOURCE_CODE)/gad_advection.f                  \                  $(SOURCE_CODE)/gad_advection.f                  \
126                  $(SOURCE_CODE)/gad_biharm_x.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/gad_biharm_x.f                   \
127                  $(SOURCE_CODE)/gad_biharm_y.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/gad_biharm_y.f                   \
# Line 121  SRC_MODEL      = \ Line 153  SRC_MODEL      = \
153                                                                  \                                                                  \
154                  $(SOURCE_CODE)/grad_sigma.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/grad_sigma.f                     \
155                  $(SOURCE_CODE)/impldiff.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/impldiff.f                       \
156                    $(SOURCE_CODE)/ini_autodiff.f                   \
157                  $(SOURCE_CODE)/ini_cartesian_grid.f             \                  $(SOURCE_CODE)/ini_cartesian_grid.f             \
158                  $(SOURCE_CODE)/ini_cg2d.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_cg2d.f                       \
                 $(SOURCE_CODE)/ini_communication_patterns.f     \  
159                  $(SOURCE_CODE)/ini_cori.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_cori.f                       \
160                  $(SOURCE_CODE)/ini_curvilinear_grid.f           \                  $(SOURCE_CODE)/ini_curvilinear_grid.f           \
161                  $(SOURCE_CODE)/ini_depths.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/ini_depths.f                     \
# Line 135  SRC_MODEL      = \ Line 167  SRC_MODEL      = \
167                  $(SOURCE_CODE)/ini_mixing.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/ini_mixing.f                     \
168                  $(SOURCE_CODE)/ini_p_ground.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/ini_p_ground.f                   \
169                  $(SOURCE_CODE)/ini_pnh.f                        \                  $(SOURCE_CODE)/ini_pnh.f                        \
170                  $(SOURCE_CODE)/ini_procs.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/ini_pressure.f                   \
171                  $(SOURCE_CODE)/ini_psurf.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/ini_psurf.f                      \
172                  $(SOURCE_CODE)/ini_salt.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_salt.f                       \
173                  $(SOURCE_CODE)/ini_spherical_polar_grid.f       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_spherical_polar_grid.f       \
# Line 153  SRC_MODEL      = \ Line 185  SRC_MODEL      = \
185                  $(SOURCE_CODE)/mom_vecinv.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/mom_vecinv.f                     \
186                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_hfacz.f                 \                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_hfacz.f                 \
187                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_ke.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_ke.f                    \
188                    $(SOURCE_CODE)/mom_calc_rtrans.f                \
189                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_strain.f                \                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_strain.f                \
190                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_tension.f               \                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_tension.f               \
191                  $(SOURCE_CODE)/mom_cdscheme.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_cdscheme.f                   \
# Line 160  SRC_MODEL      = \ Line 193  SRC_MODEL      = \
193                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_vu.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_vu.f                   \
194                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_wu.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_wu.f                   \
195                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_bottomdrag.f               \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_bottomdrag.f               \
196                    $(SOURCE_CODE)/mom_u_coriolis.f                 \
197                    $(SOURCE_CODE)/mom_u_coriolis_nh.f              \
198                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_del2u.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_del2u.f                    \
199                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_nh.f                \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_nh.f                \
200                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_sphere.f            \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_sphere.f            \
# Line 171  SRC_MODEL      = \ Line 206  SRC_MODEL      = \
206                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_adv_vv.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_adv_vv.f                   \
207                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_adv_wv.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_adv_wv.f                   \
208                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_bottomdrag.f               \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_bottomdrag.f               \
209                    $(SOURCE_CODE)/mom_v_coriolis.f                 \
210                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_del2v.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_del2v.f                    \
211                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_metric_nh.f                \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_metric_nh.f                \
212                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_metric_sphere.f            \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_metric_sphere.f            \
# Line 194  SRC_MODEL      = \ Line 230  SRC_MODEL      = \
230                                                                  \                                                                  \
231                  $(SOURCE_CODE)/packages_init_variables.f        \                  $(SOURCE_CODE)/packages_init_variables.f        \
232                  $(SOURCE_CODE)/plot_field.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/plot_field.f                     \
233                    $(SOURCE_CODE)/pressure_for_eos.f               \
234                    $(SOURCE_CODE)/quasihydrostaticterms.f          \
235                  $(SOURCE_CODE)/solve_for_pressure.f             \                  $(SOURCE_CODE)/solve_for_pressure.f             \
236                  $(SOURCE_CODE)/state_summary.f                  \                  $(SOURCE_CODE)/state_summary.f                  \
237                  $(SOURCE_CODE)/timestep.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/timestep.f                       \
238                  $(SOURCE_CODE)/the_correction_step.f            \                  $(SOURCE_CODE)/the_correction_step.f            \
                 $(SOURCE_CODE)/the_main_loop.f                  \  
239                  $(SOURCE_CODE)/thermodynamics.f                 \                  $(SOURCE_CODE)/thermodynamics.f                 \
240                  $(SOURCE_CODE)/timestep_tracer.f                \                  $(SOURCE_CODE)/timestep_tracer.f                \
241                  $(SOURCE_CODE)/swfrac.f                         \                  $(SOURCE_CODE)/swfrac.f                         \
242                    $(SOURCE_CODE)/update_etah.f                    \
243                                                                  \                                                                  \
244                  $(SOURCE_CODE)/kpp_calc.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/kpp_calc.f                       \
245                  $(SOURCE_CODE)/kpp_calc_diff.f                  \                  $(SOURCE_CODE)/kpp_calc_diff.f                  \
# Line 214  SRC_MODEL      = \ Line 252  SRC_MODEL      = \
252                  $(SOURCE_CODE)/kpp_transport_t.f                \                  $(SOURCE_CODE)/kpp_transport_t.f                \
253                                                                  \                                                                  \
254                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_diff.f               \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_diff.f               \
255                    $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_psi_b.f              \
256                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_tensor.f             \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_tensor.f             \
257                    $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_uvflow.f             \
258                    $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_wflow.f              \
259                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_diags.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_diags.f                   \
260                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_init.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_init.f                    \
261                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_rtransport.f              \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_rtransport.f              \
262                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_slope_limit.f             \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_slope_limit.f             \
263                    $(SOURCE_CODE)/gmredi_slope_psi.f               \
264                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_xtransport.f              \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_xtransport.f              \
265                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_ytransport.f              \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_ytransport.f              \
                                                                 \  
                 $(SOURCE_CODE)/ctrl_map_ini.f                   \  
                 $(SOURCE_CODE)/ctrl_map_forcing.f               \  
266                                                                  \                                                                  \
267                    $(SOURCE_CODE)/cost_aqh.f                       \
268                    $(SOURCE_CODE)/cost_argo_salt.f                 \
269                    $(SOURCE_CODE)/cost_argo_theta.f                \
270                    $(SOURCE_CODE)/cost_atemp.f                     \
271                    $(SOURCE_CODE)/cost_atlantic.f                  \
272                    $(SOURCE_CODE)/cost_averagesfields.f            \
273                    $(SOURCE_CODE)/cost_averagesflags.f             \
274                    $(SOURCE_CODE)/cost_averagesinit.f              \
275                    $(SOURCE_CODE)/cost_ctds.f                      \
276                    $(SOURCE_CODE)/cost_ctdt.f                      \
277                    $(SOURCE_CODE)/cost_drift.f                     \
278                    $(SOURCE_CODE)/cost_drifter.f                   \
279                    $(SOURCE_CODE)/cost_driftw.f                    \
280                  $(SOURCE_CODE)/cost_final.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/cost_final.f                     \
281                  $(SOURCE_CODE)/cost_init.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/cost_forcing.f                   \
282                  $(SOURCE_CODE)/cost_tile.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/cost_geoid.f                     \
283                  $(SOURCE_CODE)/cost_test.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/cost_heatflux.f                  \
284                  $(SOURCE_CODE)/cost_tracer.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/cost_hyd.f                       \
285                    $(SOURCE_CODE)/cost_initvaria.f                 \
286                    $(SOURCE_CODE)/cost_init_barfiles.f             \
287                    $(SOURCE_CODE)/cost_mean_heatflux.f             \
288                    $(SOURCE_CODE)/cost_mean_saltflux.f             \
289                    $(SOURCE_CODE)/cost_merstress.f                 \
290                    $(SOURCE_CODE)/cost_readers.f                   \
291                    $(SOURCE_CODE)/cost_readsssfields.f             \
292                    $(SOURCE_CODE)/cost_readsstfields.f             \
293                    $(SOURCE_CODE)/cost_readscatxfields.f           \
294                    $(SOURCE_CODE)/cost_readscatyfields.f           \
295                    $(SOURCE_CODE)/cost_readtopex.f                 \
296                    $(SOURCE_CODE)/cost_readtopexmean.f             \
297                    $(SOURCE_CODE)/cost_salt.f                      \
298                    $(SOURCE_CODE)/cost_salt0.f                     \
299                    $(SOURCE_CODE)/cost_saltflux.f                  \
300                    $(SOURCE_CODE)/cost_scat.f                      \
301                    $(SOURCE_CODE)/cost_ssh.f                       \
302                    $(SOURCE_CODE)/cost_ssh_mean.f                  \
303                    $(SOURCE_CODE)/cost_sss.f                       \
304                    $(SOURCE_CODE)/cost_sst.f                       \
305                    $(SOURCE_CODE)/cost_theta.f                     \
306                    $(SOURCE_CODE)/cost_theta0.f                    \
307                    $(SOURCE_CODE)/cost_uwind.f                     \
308                    $(SOURCE_CODE)/cost_vwind.f                     \
309                    $(SOURCE_CODE)/cost_xbt.f                       \
310                    $(SOURCE_CODE)/cost_zonstress.f                 \
311                    $(SOURCE_CODE)/cost_obcs.f                      \
312                    $(SOURCE_CODE)/cost_obcsn.f                     \
313                    $(SOURCE_CODE)/cost_obcss.f                     \
314                    $(SOURCE_CODE)/cost_obcsw.f                     \
315                    $(SOURCE_CODE)/cost_obcse.f                     \
316                    $(SOURCE_CODE)/cost_obcs_ageos.f                \
317                    $(SOURCE_CODE)/cost_ice.f                       \
318                    $(SOURCE_CODE)/sw_ptmp.f                        \
319                    $(SOURCE_CODE)/sw_adtg.f                        \
320                    $(SOURCE_CODE)/cost_kapgm.f                     \
321                    $(SOURCE_CODE)/cost_readargot.f                 \
322                    $(SOURCE_CODE)/cost_readargos.f                 \
323                    $(SOURCE_CODE)/cost_ctdtclim.f                  \
324                    $(SOURCE_CODE)/cost_ctdsclim.f                  \
325                    $(SOURCE_CODE)/cost_readtmifields.f             \
326                    $(SOURCE_CODE)/cost_tmi.f                       \
327                    $(SOURCE_CODE)/cost_curmtr.f                    \
328                                                                  \                                                                  \
329                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_get_gen.f                   \
330                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_get_gen_rec.f               \
331                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getobcsn.f                  \
332                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getobcss.f                  \
333                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getobcsw.f                  \
334                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getobcse.f                  \
335                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getrec.f                    \
336                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_init_variables.f            \
337                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_map_ini.f                   \
338                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_volflux.f                   \
339                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_init_obcs_variables.f       \
340                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_obcsbal.f                   \
341                                                                    \
342                    $(SOURCE_CODE)/ecco_the_main_loop.f             \
343                                                                    \
344                    $(SOURCE_CODE)/exf_init.f                       \
345                    $(SOURCE_CODE)/exf_init_runoff.f                \
346                    $(SOURCE_CODE)/exf_readparms.f                  \
347                    $(SOURCE_CODE)/exf_summary.f                    \
348                    $(SOURCE_CODE)/exf_bulkformulae.f               \
349                    $(SOURCE_CODE)/exf_bulkcdn.f                    \
350                    $(SOURCE_CODE)/exf_bulkqsat.f                   \
351                    $(SOURCE_CODE)/exf_bulkrhn.f                    \
352                    $(SOURCE_CODE)/exf_getffields.f                 \
353                    $(SOURCE_CODE)/exf_getffieldrec.f               \
354                    $(SOURCE_CODE)/exf_getforcing.f                 \
355                    $(SOURCE_CODE)/exf_mapfields.f                  \
356                    $(SOURCE_CODE)/exf_getobcs.f                    \
357                    $(SOURCE_CODE)/exf_getsurfacefluxes.f           \
358                    $(SOURCE_CODE)/exf_swapffields.f                \
359                    $(SOURCE_CODE)/exf_filter_rl.f                  \
360                    $(SOURCE_CODE)/exf_filter_rs.f                  \
361                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_gen.f                    \
362                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_obcs.f                   \
363                                                                    \
364                    $(SOURCE_CODE)/exf_clim_init.f                  \
365                    $(SOURCE_CODE)/exf_clim_readparms.f             \
366                    $(SOURCE_CODE)/exf_clim_summary.f               \
367                    $(SOURCE_CODE)/exf_getclim.f                    \
368                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_climsalt.f               \
369                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_climtemp.f               \
370                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_climsss.f                \
371                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_climsst.f                \
372                                                                    \
373                    $(SOURCE_CODE)/cal_addtime.f                    \
374                    $(SOURCE_CODE)/cal_checkdate.f                  \
375                    $(SOURCE_CODE)/cal_compdates.f                  \
376                    $(SOURCE_CODE)/cal_convdate.f                   \
377                    $(SOURCE_CODE)/cal_copydate.f                   \
378                    $(SOURCE_CODE)/cal_daysformonth.f               \
379                    $(SOURCE_CODE)/cal_dayspermonth.f               \
380                    $(SOURCE_CODE)/cal_fulldate.f                   \
381                    $(SOURCE_CODE)/cal_getdate.f                    \
382                    $(SOURCE_CODE)/cal_getmonthsrec.f               \
383                    $(SOURCE_CODE)/cal_intdays.f                    \
384                    $(SOURCE_CODE)/cal_intmonths.f                  \
385                    $(SOURCE_CODE)/cal_intsteps.f                   \
386                    $(SOURCE_CODE)/cal_intyears.f                   \
387                    $(SOURCE_CODE)/cal_isleap.f                     \
388                    $(SOURCE_CODE)/cal_monthsforyear.f              \
389                    $(SOURCE_CODE)/cal_monthsperyear.f              \
390                    $(SOURCE_CODE)/cal_nstepday.f                   \
391                    $(SOURCE_CODE)/cal_numints.f                    \
392                    $(SOURCE_CODE)/cal_printdate.f                  \
393                    $(SOURCE_CODE)/cal_printerror.f                 \
394                    $(SOURCE_CODE)/cal_stepsforday.f                \
395                    $(SOURCE_CODE)/cal_stepsperday.f                \
396                    $(SOURCE_CODE)/cal_subdates.f                   \
397                    $(SOURCE_CODE)/cal_timeinterval.f               \
398                    $(SOURCE_CODE)/cal_timepassed.f                 \
399                    $(SOURCE_CODE)/cal_timestamp.f                  \
400                    $(SOURCE_CODE)/cal_toseconds.f                  \
401                    $(SOURCE_CODE)/cal_weekday.f                    \
402                                                                    \
403                    $(SOURCE_CODE)/obcs_apply_sloc.f                \
404                    $(SOURCE_CODE)/obcs_apply_tloc.f                \
405                    $(SOURCE_CODE)/obcs_apply_ts.f                  \
406                    $(SOURCE_CODE)/obcs_apply_uv.f                  \
407                    $(SOURCE_CODE)/obcs_calc.f                      \
408                    $(SOURCE_CODE)/obcs_init_variables.f            \
409                    $(SOURCE_CODE)/obcs_sponge.f
410    
411    
412    #               $(SOURCE_CODE)/advect.f                         \
413    #               $(SOURCE_CODE)/budget.f                         \
414    #               $(SOURCE_CODE)/diffus.f                         \
415    #               $(SOURCE_CODE)/dynsolver.f                      \
416    #               $(SOURCE_CODE)/groatb.f                         \
417    #               $(SOURCE_CODE)/growth.f                         \
418    #               $(SOURCE_CODE)/ostres.f                         \
419    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_check.f                   \
420    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_do_diags.f                \
421    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_get_forcing.f             \
422    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_init.f                    \
423    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_model.f                   \
424    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_pickup.f                  \
425    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_readparms.f               \
426    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_exch.f                    \
427    #               $(SOURCE_CODE)/lsr.f
428    #               $(SOURCE_CODE)/adi.f
429    
430    
431  #--------------------------------------------------------  #--------------------------------------------------------
432  # rules  # rules
433  #--------------------------------------------------------  #--------------------------------------------------------
434    
435    small_f:
436            cd $(SOURCE_CODE); $(MAKE) depend; $(MAKE) small_f
437    
438  allcode:  allcode:
439          cd $(DEST) ; cat $(SRC_MODEL) >! tamc_code_ecco.f          cd $(DEST) ; cat $(SRC_MODEL) >! tamc_code_ecco.f
440    
# Line 247  admodeltamc: Line 445  admodeltamc:
445  admodeltaf:  admodeltaf:
446          cd $(DEST) ; $(TAF) $(ADTAFFLAG) tamc_code_ecco.f          cd $(DEST) ; $(TAF) $(ADTAFFLAG) tamc_code_ecco.f
447    
448  tlmodeltamc:  ftlmodeltamc:
449          cd $(DEST) ; $(TAMC) $(TLTAMCFLAG) tamc_code_ecco.f     \          cd $(DEST) ; $(TAMC) $(FTLTAMCFLAG) tamc_code_ecco.f    \
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451    
452    ftlmodeltaf:
453            cd $(DEST) ; $(TAF) $(FTLTAFFLAG) tamc_code_ecco.f
454    
455  tlmodeltaf:  svdmodeltaf:
456          cd $(DEST) ; $(TAF) $(TLTAFFLAG) tamc_code_ecco.f          cd $(DEST) ; $(TAF) $(SVDTAFFLAG) tamc_code_ecco.f
457    
458  adchange:  adchange:
459          ${ADJOINT_SCRIPT}/adjoint_ecco_sed.com \          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_template     \
460             >! tamc_code_ecco_sed_ad.f ;  \             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F ;            \
461            ${ADJOINT_SCRIPT}/adjoint_sed.com               \
462               >! tamc_code_ecco_sed_ad.f ;                         \
463          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F              \          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F              \
464             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_old ;        \             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_old ;        \
465          cat tamc_code_ecco_sed_ad.f >> $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F          cat tamc_code_ecco_sed_ad.f >> $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F
466    
467    ftlchange:
468            cp $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F_template       \
469               $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F ;              \
470            cp $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F                \
471               $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F_old ;          \
472            cat tamc_code_ecco_ftl.f >> $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F
473    
474    bothchange:   adchange ftlchange
475    
476  adrestore:  adrestore:
477          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_template     \          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_template     \
478             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F
479    
480  tltamc:  allcode tlmodeltamc  ftlrestore:
481            cp $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F_template       \
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483    
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493    
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495    
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497    
 adtaf:  adrestore allcode admodeltaf  
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