/[MITgcm]/MITgcm/adjoint/makefile
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revision 1.10 by heimbach, Wed Aug 15 14:12:48 2001 UTC revision 1.20 by heimbach, Thu Jan 17 16:55:25 2002 UTC
# Line 7  DEST             = . Line 7  DEST             = .
7  SOURCE_CODE      = ../bin  SOURCE_CODE      = ../bin
8  ADJOINT_SCRIPT   = ../adjoint  ADJOINT_SCRIPT   = ../adjoint
9  BASE             = ..  BASE             = ..
 ADTAMCFLAGS      = -reverse -i4 -r4 -admark  ad  
 ADTAFFLAGS       = -reverse -i4 -r4 -admark  ad  
 TLTAMCFLAGS      = -forward -i4 -r4 -ftlmark g_  
 TLTAFFLAGS       = -forward -i4 -r4 -ftlmark g_  
10  PKG             = $(BASE)/pkg  PKG             = $(BASE)/pkg
11    #
12    ADTAMCFLAGS      = -reverse -admark ad -i4 -r4
13    ADTAFFLAGS       = -reverse -admark ad -i4 -r4 \
14                            -flow taf_flow.log -nonew_arg
15    FTLTAMCFLAGS     = -forward -ftlmark g_ -i4 -r4
16    FTLTAFFLAGS      = -forward -ftlmark g_ -i4 -r4 \
17                            -flow taf_flow.log -nonew_arg
18    SVDTAMCFLAGS     = -reverse -forward -pure -i4 -r4
19    SVDTAFFLAGS      = -reverse -forward -pure -i4 -r4 \
20                            -flow taf_flow.log -nonew_arg
21    #
22    # -warn_step -flow taf_flow.log
23    
24  DIFF_FLAGS       = -toplevel the_main_loop              \  DIFF_FLAGS       = -toplevel the_main_loop              \
25                     -input  '    xx_theta_dummy          \                     -input  '    xx_theta_dummy          \
# Line 26  DIFF_FLAGS       = -toplevel the_main_lo Line 34  DIFF_FLAGS       = -toplevel the_main_lo
34                                  xx_diffkr_dummy         \                                  xx_diffkr_dummy         \
35                                  xx_kapgm_dummy'         \                                  xx_kapgm_dummy'         \
36                     -output 'fc'                     -output 'fc'
37    #
38    #                   -output 'objf_vector'
39    #                   -output 'fc'
40    
41  ADTAMCFLAG         = $(ADTAMCFLAGS) $(DIFF_FLAGS)  ADTAMCFLAG         = $(ADTAMCFLAGS) $(DIFF_FLAGS)
42  ADTAFFLAG          = $(ADTAFFLAGS)  $(DIFF_FLAGS)  ADTAFFLAG          = $(ADTAFFLAGS)  $(DIFF_FLAGS)
43    
44  TLTAMCFLAG         = $(TLTAMCFLAGS) $(DIFF_FLAGS)  FTLTAMCFLAG         = $(FTLTAMCFLAGS) $(DIFF_FLAGS)
45  TLTAFFLAG          = $(TLTAFFLAGS)  $(DIFF_FLAGS)  FTLTAFFLAG          = $(FTLTAFFLAGS)  $(DIFF_FLAGS)
46    
47    SVDTAMCFLAG         = $(SVDTAMCFLAGS) $(DIFF_FLAGS)
48    SVDTAFFLAG          = $(SVDTAFFLAGS)  $(DIFF_FLAGS)
49    
50  # Source files for the MITgcmUV  # Source files for the MITgcmUV
51  SRC_MODEL       = \  SRC_MODEL       = \
# Line 60  SRC_MODEL      = \ Line 74  SRC_MODEL      = \
74                  $(PKG)/autodiff/open_copy_data_file.flow\                  $(PKG)/autodiff/open_copy_data_file.flow\
75                  $(PKG)/autodiff/timeave.flow            \                  $(PKG)/autodiff/timeave.flow            \
76                                                                  \                                                                  \
77                    $(SOURCE_CODE)/adams_bashforth2.f               \
78                  $(SOURCE_CODE)/calc_buoyancy.f                  \                  $(SOURCE_CODE)/calc_buoyancy.f                  \
79                  $(SOURCE_CODE)/calc_common_factors.f            \                  $(SOURCE_CODE)/calc_common_factors.f            \
80                  $(SOURCE_CODE)/calc_diffusivity.f               \                  $(SOURCE_CODE)/calc_diffusivity.f               \
81                  $(SOURCE_CODE)/calc_div_ghat.f                  \                  $(SOURCE_CODE)/calc_div_ghat.f                  \
82                    $(SOURCE_CODE)/calc_exact_eta.f                 \
83                  $(SOURCE_CODE)/calc_grad_phi_surf.f             \                  $(SOURCE_CODE)/calc_grad_phi_surf.f             \
84                  $(SOURCE_CODE)/calc_gs.f                        \                  $(SOURCE_CODE)/calc_gs.f                        \
85                  $(SOURCE_CODE)/calc_gt.f                        \                  $(SOURCE_CODE)/calc_gt.f                        \
86                  $(SOURCE_CODE)/calc_gtr1.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/calc_gtr1.f                      \
87                  $(SOURCE_CODE)/calc_ivdc.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/calc_ivdc.f                      \
                 $(SOURCE_CODE)/calc_mom_rhs.f                   \  
88                  $(SOURCE_CODE)/calc_phi_hyd.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/calc_phi_hyd.f                   \
89                  $(SOURCE_CODE)/calc_viscosity.f                 \                  $(SOURCE_CODE)/calc_viscosity.f                 \
90                  $(SOURCE_CODE)/comm_stats.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/comm_stats.f                     \
# Line 88  SRC_MODEL      = \ Line 103  SRC_MODEL      = \
103                  $(SOURCE_CODE)/find_rho.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/find_rho.f                       \
104                  $(SOURCE_CODE)/forward_step.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/forward_step.f                   \
105                  $(SOURCE_CODE)/freeze.f                         \                  $(SOURCE_CODE)/freeze.f                         \
106                  $(SOURCE_CODE)/get_offline_fields.f             \                                                                  \
107                    $(SOURCE_CODE)/gad_advection.f                  \
108                  $(SOURCE_CODE)/gad_biharm_x.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/gad_biharm_x.f                   \
109                  $(SOURCE_CODE)/gad_biharm_y.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/gad_biharm_y.f                   \
110                  $(SOURCE_CODE)/gad_c2_adv_r.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/gad_c2_adv_r.f                   \
# Line 102  SRC_MODEL      = \ Line 118  SRC_MODEL      = \
118                  $(SOURCE_CODE)/gad_diff_r.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/gad_diff_r.f                     \
119                  $(SOURCE_CODE)/gad_diff_x.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/gad_diff_x.f                     \
120                  $(SOURCE_CODE)/gad_diff_y.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/gad_diff_y.f                     \
121                    $(SOURCE_CODE)/gad_dst3_adv_x.f                 \
122                    $(SOURCE_CODE)/gad_dst3_adv_y.f                 \
123                    $(SOURCE_CODE)/gad_dst3_adv_r.f                 \
124                    $(SOURCE_CODE)/gad_dst3fl_adv_x.f               \
125                    $(SOURCE_CODE)/gad_dst3fl_adv_y.f               \
126                    $(SOURCE_CODE)/gad_dst3fl_adv_r.f               \
127                  $(SOURCE_CODE)/gad_fluxlimit_adv_r.f            \                  $(SOURCE_CODE)/gad_fluxlimit_adv_r.f            \
128                  $(SOURCE_CODE)/gad_fluxlimit_adv_x.f            \                  $(SOURCE_CODE)/gad_fluxlimit_adv_x.f            \
129                  $(SOURCE_CODE)/gad_fluxlimit_adv_y.f            \                  $(SOURCE_CODE)/gad_fluxlimit_adv_y.f            \
# Line 110  SRC_MODEL      = \ Line 132  SRC_MODEL      = \
132                  $(SOURCE_CODE)/gad_u3_adv_r.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/gad_u3_adv_r.f                   \
133                  $(SOURCE_CODE)/gad_u3_adv_x.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/gad_u3_adv_x.f                   \
134                  $(SOURCE_CODE)/gad_u3_adv_y.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/gad_u3_adv_y.f                   \
135                                                                    \
136                  $(SOURCE_CODE)/grad_sigma.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/grad_sigma.f                     \
137                  $(SOURCE_CODE)/impldiff.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/impldiff.f                       \
138                    $(SOURCE_CODE)/ini_autodiff.f                   \
139                  $(SOURCE_CODE)/ini_cartesian_grid.f             \                  $(SOURCE_CODE)/ini_cartesian_grid.f             \
140                  $(SOURCE_CODE)/ini_cg2d.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_cg2d.f                       \
141                  $(SOURCE_CODE)/ini_communication_patterns.f     \                  $(SOURCE_CODE)/ini_communication_patterns.f     \
# Line 126  SRC_MODEL      = \ Line 150  SRC_MODEL      = \
150                  $(SOURCE_CODE)/ini_mixing.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/ini_mixing.f                     \
151                  $(SOURCE_CODE)/ini_p_ground.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/ini_p_ground.f                   \
152                  $(SOURCE_CODE)/ini_pnh.f                        \                  $(SOURCE_CODE)/ini_pnh.f                        \
                 $(SOURCE_CODE)/ini_procs.f                      \  
153                  $(SOURCE_CODE)/ini_psurf.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/ini_psurf.f                      \
154                  $(SOURCE_CODE)/ini_salt.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_salt.f                       \
155                  $(SOURCE_CODE)/ini_spherical_polar_grid.f       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_spherical_polar_grid.f       \
# Line 138  SRC_MODEL      = \ Line 161  SRC_MODEL      = \
161                  $(SOURCE_CODE)/initialise_varia.f               \                  $(SOURCE_CODE)/initialise_varia.f               \
162                  $(SOURCE_CODE)/integrate_for_w.f                \                  $(SOURCE_CODE)/integrate_for_w.f                \
163                  $(SOURCE_CODE)/modeldata_example.f              \                  $(SOURCE_CODE)/modeldata_example.f              \
164                                                                    \
165                    $(SOURCE_CODE)/mom_fluxform.f                   \
166                    $(SOURCE_CODE)/mom_hdissip.f                    \
167                    $(SOURCE_CODE)/mom_vecinv.f                     \
168                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_hfacz.f                 \                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_hfacz.f                 \
169                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_ke.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_ke.f                    \
170                    $(SOURCE_CODE)/mom_calc_strain.f                \
171                    $(SOURCE_CODE)/mom_calc_tension.f               \
172                  $(SOURCE_CODE)/mom_cdscheme.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_cdscheme.f                   \
173                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_uu.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_uu.f                   \
174                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_vu.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_vu.f                   \
175                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_wu.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_wu.f                   \
176                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_bottomdrag.f               \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_bottomdrag.f               \
177                    $(SOURCE_CODE)/mom_u_coriolis.f                 \
178                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_del2u.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_del2u.f                    \
179                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_nh.f                \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_nh.f                \
180                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_sphere.f            \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_sphere.f            \
# Line 156  SRC_MODEL      = \ Line 186  SRC_MODEL      = \
186                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_adv_vv.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_adv_vv.f                   \
187                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_adv_wv.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_adv_wv.f                   \
188                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_bottomdrag.f               \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_bottomdrag.f               \
189                    $(SOURCE_CODE)/mom_v_coriolis.f                 \
190                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_del2v.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_del2v.f                    \
191                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_metric_nh.f                \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_metric_nh.f                \
192                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_metric_sphere.f            \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_metric_sphere.f            \
# Line 163  SRC_MODEL      = \ Line 194  SRC_MODEL      = \
194                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_sidedrag.f                 \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_sidedrag.f                 \
195                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_xviscflux.f                \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_xviscflux.f                \
196                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_yviscflux.f                \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_yviscflux.f                \
197                    $(SOURCE_CODE)/mom_vi_calc_absvort3.f           \
198                    $(SOURCE_CODE)/mom_vi_calc_hdiv.f               \
199                    $(SOURCE_CODE)/mom_vi_calc_ke.f                 \
200                    $(SOURCE_CODE)/mom_vi_calc_relvort3.f           \
201                    $(SOURCE_CODE)/mom_vi_coriolis.f                \
202                    $(SOURCE_CODE)/mom_vi_del2uv.f                  \
203                    $(SOURCE_CODE)/mom_vi_hdissip.f                 \
204                    $(SOURCE_CODE)/mom_vi_u_coriolis.f              \
205                    $(SOURCE_CODE)/mom_vi_u_grad_ke.f               \
206                    $(SOURCE_CODE)/mom_vi_u_vertshear.f             \
207                    $(SOURCE_CODE)/mom_vi_v_coriolis.f              \
208                    $(SOURCE_CODE)/mom_vi_v_grad_ke.f               \
209                    $(SOURCE_CODE)/mom_vi_v_vertshear.f             \
210                                                                    \
211                  $(SOURCE_CODE)/packages_init_variables.f        \                  $(SOURCE_CODE)/packages_init_variables.f        \
212                  $(SOURCE_CODE)/plot_field.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/plot_field.f                     \
213                  $(SOURCE_CODE)/solve_for_pressure.f             \                  $(SOURCE_CODE)/solve_for_pressure.f             \
# Line 201  SRC_MODEL      = \ Line 246  SRC_MODEL      = \
246                  $(SOURCE_CODE)/cost_tile.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/cost_tile.f                      \
247                  $(SOURCE_CODE)/cost_test.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/cost_test.f                      \
248                  $(SOURCE_CODE)/cost_tracer.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/cost_tracer.f                    \
249                    $(SOURCE_CODE)/cost_atlantic_heat.f             \
250                    $(SOURCE_CODE)/cost_vector.f                    \
251                                                                    \
252                    $(SOURCE_CODE)/shap_filt_apply_ts.f             \
253                    $(SOURCE_CODE)/shap_filt_apply_uv.f             \
254                    $(SOURCE_CODE)/shap_filt_tracer_s1.f            \
255                    $(SOURCE_CODE)/shap_filt_tracer_s2.f            \
256                    $(SOURCE_CODE)/shap_filt_tracer_s2g.f           \
257                    $(SOURCE_CODE)/shap_filt_tracer_s4.f            \
258                    $(SOURCE_CODE)/shap_filt_uv_s1.f                \
259                    $(SOURCE_CODE)/shap_filt_uv_s2.f                \
260                    $(SOURCE_CODE)/shap_filt_uv_s2g.f               \
261                    $(SOURCE_CODE)/shap_filt_uv_s4.f                \
262                                                                    \
263    
264    #               $(SOURCE_CODE)/calc_ep_forcing.f                \
265    #               $(SOURCE_CODE)/cost_entropy.f                   \
266    #               $(SOURCE_CODE)/ini_ep.f                         \
267                                                                  \                                                                  \
268    
269    
# Line 209  SRC_MODEL      = \ Line 272  SRC_MODEL      = \
272  #--------------------------------------------------------  #--------------------------------------------------------
273    
274  allcode:  allcode:
275          cd $(DEST) ; cat $(SRC_MODEL) >! tamc_code_ecco.f          cd $(DEST) ; cat $(SRC_MODEL) >! tamc_code.f
276    
277  admodeltamc:  admodeltamc:
278          cd $(DEST) ; $(TAMC) $(ADTAMCFLAG) tamc_code_ecco.f     \          cd $(DEST) ; $(TAMC) $(ADTAMCFLAG) tamc_code.f  \
279             >! tamc_code_ecco_ad.prot             >! tamc_code_ad.prot
280    
281  admodeltaf:  admodeltaf:
282          cd $(DEST) ; $(TAF) $(ADTAFFLAG) tamc_code_ecco.f          cd $(DEST) ; $(TAF) $(ADTAFFLAG) tamc_code.f
283    
284    ftlmodeltamc:
285            cd $(DEST) ; $(TAMC) $(FTLTAMCFLAG) tamc_code.f \
286               >! tamc_code_ftl.prot
287    
288  tlmodeltamc:  ftlmodeltaf:
289          cd $(DEST) ; $(TAMC) $(TLTAMCFLAG) tamc_code_ecco.f     \          cd $(DEST) ; $(TAF) $(FTLTAFFLAG) tamc_code.f
            >! tamc_code_ecco_tl.prot  
290    
291  tlmodeltaf:  svdmodeltaf:
292          cd $(DEST) ; $(TAF) $(TLTAFFLAG) tamc_code_ecco.f          cd $(DEST) ; $(TAF) $(SVDTAFFLAG) tamc_code.f
293    
294  adchange:  adchange:
295          ${ADJOINT_SCRIPT}/adjoint_ecco_sed.com \          ${ADJOINT_SCRIPT}/adjoint_sed.com \
296             >! tamc_code_ecco_sed_ad.f ;  \             >! tamc_code_sed_ad.f ;  \
297          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F              \          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F              \
298             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_old ;        \             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_old ;        \
299          cat tamc_code_ecco_sed_ad.f >> $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F          cat tamc_code_sed_ad.f >> $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F
300    
301    ftlchange:
302            cp $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F                \
303               $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F_old ;  \
304            cat tamc_code_ftl.f >> $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F
305    
306  adrestore:  adrestore:
307          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_template     \          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_template     \
308             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F
309    
310  tltamc:  allcode tlmodeltamc  ftlrestore:
311            cp $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F_template       \
312               $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F
313    
314    adtamc:  adrestore ftlrestore allcode admodeltamc
315    
316    adtaf:  adrestore ftlrestore allcode admodeltaf
317    
318    ftltamc:  adrestore ftlrestore allcode ftlmodeltamc
319    
320  tltaf:  allcode tlmodeltaf  ftltaf:  adrestore ftlrestore allcode ftlmodeltaf
321    
322  adtamc:  allcode admodeltamc  svdtaf:  adrestore ftlrestore allcode svdmodeltaf
323    
 adtaf:  allcode admodeltaf  
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