/[MITgcm]/MITgcm/adjoint/makefile
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revision 1.24 by heimbach, Tue Nov 12 20:39:46 2002 UTC revision 1.28 by heimbach, Fri Feb 28 02:20:52 2003 UTC
# Line 3  RM               = rm -f Line 3  RM               = rm -f
3  LOC              = $(PWD)  LOC              = $(PWD)
4  TAMC             = tamc  TAMC             = tamc
5  ###TAMC             = /data43/ralf/tamc/tamc  ###TAMC             = /data43/ralf/tamc/tamc
6  TAF              = taf  ###TAF              = taf
7  ###TAF              = ~fastopt/bin/taf  TAF              = ~fastopt/bin/taf
8  DEST             = .  DEST             = .
9  SOURCE_CODE      = ../bin  SOURCE_CODE      = ../bin
10  ADJOINT_SCRIPT   = ../adjoint  ADJOINT_SCRIPT   = ../adjoint
# Line 13  PKG            = $(BASE)/pkg Line 13  PKG            = $(BASE)/pkg
13  #  #
14  ADTAMCFLAGS      = -reverse -admark ad -i4 -r4  ADTAMCFLAGS      = -reverse -admark ad -i4 -r4
15  ADTAFFLAGS       = -reverse -admark ad -i4 -r4 \  ADTAFFLAGS       = -reverse -admark ad -i4 -r4 \
16                          -flow taf_flow.log -nonew_arg                          -l taf_ad.log -flow taf_ad_flow.log -nonew_arg
17  FTLTAMCFLAGS     = -forward -ftlmark g_ -i4 -r4  FTLTAMCFLAGS     = -forward -ftlmark g_ -i4 -r4
18  FTLTAFFLAGS      = -forward -ftlmark g_ -i4 -r4 \  FTLTAFFLAGS      = -forward -ftlmark g_ -i4 -r4 \
19                          -flow taf_flow.log -nonew_arg                          -l taf_ftl.log -flow taf_ftl_flow.log -nonew_arg
20  SVDTAMCFLAGS     = -reverse -forward -pure -i4 -r4  SVDTAMCFLAGS     = -reverse -forward -pure -i4 -r4
21  SVDTAFFLAGS      = -reverse -forward -pure -i4 -r4 \  SVDTAFFLAGS      = -reverse -forward -pure -i4 -r4 \
22                          -flow taf_flow.log -nonew_arg                          -flow taf_flow.log -nonew_arg
23  #  #
24  # -warn_step -flow taf_flow.log  # further useful options: -warn_step -flow taf_flow.log
25    # NB: the svd option recommended in the TAMC manual doesn't work.
26    
27  DIFF_FLAGS       = -toplevel the_main_loop              \  DIFF_FLAGS       = -toplevel the_main_loop              \
28                     -input  '    xx_theta_dummy          \                     -input  '    xx_theta_dummy          \
# Line 83  SRC_MODEL      = \ Line 84  SRC_MODEL      = \
84                  $(SOURCE_CODE)/calc_common_factors.f            \                  $(SOURCE_CODE)/calc_common_factors.f            \
85                  $(SOURCE_CODE)/calc_diffusivity.f               \                  $(SOURCE_CODE)/calc_diffusivity.f               \
86                  $(SOURCE_CODE)/calc_div_ghat.f                  \                  $(SOURCE_CODE)/calc_div_ghat.f                  \
87                  $(SOURCE_CODE)/calc_exact_eta.f                 \                  $(SOURCE_CODE)/calc_grad_phi_hyd.f              \
88                  $(SOURCE_CODE)/calc_grad_phi_surf.f             \                  $(SOURCE_CODE)/calc_grad_phi_surf.f             \
89                  $(SOURCE_CODE)/calc_gs.f                        \                  $(SOURCE_CODE)/calc_gs.f                        \
90                  $(SOURCE_CODE)/calc_gt.f                        \                  $(SOURCE_CODE)/calc_gt.f                        \
# Line 99  SRC_MODEL      = \ Line 100  SRC_MODEL      = \
100                  $(SOURCE_CODE)/convectively_mixtracer.f         \                  $(SOURCE_CODE)/convectively_mixtracer.f         \
101                  $(SOURCE_CODE)/correction_step.f                \                  $(SOURCE_CODE)/correction_step.f                \
102                  $(SOURCE_CODE)/cycle_tracer.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/cycle_tracer.f                   \
103                    $(SOURCE_CODE)/diags_phi_hyd.f                  \
104                    $(SOURCE_CODE)/diags_phi_rlow.f                 \
105                  $(SOURCE_CODE)/different_multiple.f             \                  $(SOURCE_CODE)/different_multiple.f             \
106                  $(SOURCE_CODE)/do_fields_blocking_exchanges.f   \                  $(SOURCE_CODE)/do_fields_blocking_exchanges.f   \
107                    $(SOURCE_CODE)/do_stagger_fields_exchanges.f    \
108                  $(SOURCE_CODE)/dynamics.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/dynamics.f                       \
109                  $(SOURCE_CODE)/external_fields_load.f           \                  $(SOURCE_CODE)/external_fields_load.f           \
110                  $(SOURCE_CODE)/external_forcing.f               \                  $(SOURCE_CODE)/external_forcing.f               \
# Line 155  SRC_MODEL      = \ Line 159  SRC_MODEL      = \
159                  $(SOURCE_CODE)/ini_masks_etc.f                  \                  $(SOURCE_CODE)/ini_masks_etc.f                  \
160                  $(SOURCE_CODE)/ini_mixing.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/ini_mixing.f                     \
161                  $(SOURCE_CODE)/ini_p_ground.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/ini_p_ground.f                   \
162                    $(SOURCE_CODE)/ini_pressure.f                   \
163                  $(SOURCE_CODE)/ini_pnh.f                        \                  $(SOURCE_CODE)/ini_pnh.f                        \
164                  $(SOURCE_CODE)/ini_psurf.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/ini_psurf.f                      \
165                  $(SOURCE_CODE)/ini_salt.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_salt.f                       \
# Line 166  SRC_MODEL      = \ Line 171  SRC_MODEL      = \
171                  $(SOURCE_CODE)/ini_vertical_grid.f              \                  $(SOURCE_CODE)/ini_vertical_grid.f              \
172                  $(SOURCE_CODE)/initialise_varia.f               \                  $(SOURCE_CODE)/initialise_varia.f               \
173                  $(SOURCE_CODE)/integrate_for_w.f                \                  $(SOURCE_CODE)/integrate_for_w.f                \
174                    $(SOURCE_CODE)/integr_continuity.f              \
175                  $(SOURCE_CODE)/modeldata_example.f              \                  $(SOURCE_CODE)/modeldata_example.f              \
176                                                                  \                                                                  \
177                  $(SOURCE_CODE)/mom_fluxform.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_fluxform.f                   \
# Line 173  SRC_MODEL      = \ Line 179  SRC_MODEL      = \
179                  $(SOURCE_CODE)/mom_vecinv.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/mom_vecinv.f                     \
180                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_hfacz.f                 \                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_hfacz.f                 \
181                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_ke.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_ke.f                    \
182                    $(SOURCE_CODE)/mom_calc_rtrans.f                \
183                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_strain.f                \                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_strain.f                \
184                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_tension.f               \                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_tension.f               \
185                  $(SOURCE_CODE)/mom_cdscheme.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_cdscheme.f                   \
# Line 181  SRC_MODEL      = \ Line 188  SRC_MODEL      = \
188                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_wu.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_wu.f                   \
189                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_bottomdrag.f               \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_bottomdrag.f               \
190                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_coriolis.f                 \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_coriolis.f                 \
191                    $(SOURCE_CODE)/mom_u_coriolis_nh.f              \
192                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_del2u.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_del2u.f                    \
193                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_nh.f                \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_nh.f                \
194                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_sphere.f            \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_sphere.f            \
# Line 216  SRC_MODEL      = \ Line 224  SRC_MODEL      = \
224                                                                  \                                                                  \
225                  $(SOURCE_CODE)/packages_init_variables.f        \                  $(SOURCE_CODE)/packages_init_variables.f        \
226                  $(SOURCE_CODE)/plot_field.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/plot_field.f                     \
227                    $(SOURCE_CODE)/pressure_for_eos.f               \
228                    $(SOURCE_CODE)/quasihydrostaticterms.f          \
229                  $(SOURCE_CODE)/solve_for_pressure.f             \                  $(SOURCE_CODE)/solve_for_pressure.f             \
230                  $(SOURCE_CODE)/state_summary.f                  \                  $(SOURCE_CODE)/state_summary.f                  \
231                  $(SOURCE_CODE)/timestep.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/timestep.f                       \
# Line 223  SRC_MODEL      = \ Line 233  SRC_MODEL      = \
233                  $(SOURCE_CODE)/the_main_loop.f                  \                  $(SOURCE_CODE)/the_main_loop.f                  \
234                  $(SOURCE_CODE)/thermodynamics.f                 \                  $(SOURCE_CODE)/thermodynamics.f                 \
235                  $(SOURCE_CODE)/timestep_tracer.f                \                  $(SOURCE_CODE)/timestep_tracer.f                \
236                    $(SOURCE_CODE)/update_etah.f                    \
237                  $(SOURCE_CODE)/swfrac.f                         \                  $(SOURCE_CODE)/swfrac.f                         \
238                                                                  \                                                                  \
                 $(SOURCE_CODE)/kpp_calc.f                       \  
                 $(SOURCE_CODE)/kpp_calc_diff.f                  \  
                 $(SOURCE_CODE)/kpp_calc_visc.f                  \  
                 $(SOURCE_CODE)/kpp_do_diags.f                   \  
                 $(SOURCE_CODE)/kpp_init.f                       \  
                 $(SOURCE_CODE)/kpp_open_diags.f                 \  
                 $(SOURCE_CODE)/kpp_routines.f                   \  
                 $(SOURCE_CODE)/kpp_transport_s.f                \  
                 $(SOURCE_CODE)/kpp_transport_t.f                \  
                                                                 \  
239                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_diff.f               \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_diff.f               \
240                    $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_psi_b.f              \
241                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_tensor.f             \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_tensor.f             \
242                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_uvflow.f             \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_uvflow.f             \
243                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_wflow.f              \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_wflow.f              \
# Line 243  SRC_MODEL      = \ Line 245  SRC_MODEL      = \
245                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_init.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_init.f                    \
246                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_rtransport.f              \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_rtransport.f              \
247                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_slope_limit.f             \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_slope_limit.f             \
248                    $(SOURCE_CODE)/gmredi_slope_psi.f               \
249                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_xtransport.f              \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_xtransport.f              \
250                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_ytransport.f              \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_ytransport.f              \
251                                                                  \                                                                  \
# Line 257  SRC_MODEL      = \ Line 260  SRC_MODEL      = \
260                  $(SOURCE_CODE)/cost_atlantic_heat.f             \                  $(SOURCE_CODE)/cost_atlantic_heat.f             \
261                  $(SOURCE_CODE)/cost_vector.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/cost_vector.f                    \
262                                                                  \                                                                  \
                 $(SOURCE_CODE)/shap_filt_apply_ts.f             \  
                 $(SOURCE_CODE)/shap_filt_apply_uv.f             \  
                 $(SOURCE_CODE)/shap_filt_tracer_s1.f            \  
                 $(SOURCE_CODE)/shap_filt_tracer_s2.f            \  
                 $(SOURCE_CODE)/shap_filt_tracer_s2g.f           \  
                 $(SOURCE_CODE)/shap_filt_tracer_s4.f            \  
                 $(SOURCE_CODE)/shap_filt_uv_s1.f                \  
                 $(SOURCE_CODE)/shap_filt_uv_s2.f                \  
                 $(SOURCE_CODE)/shap_filt_uv_s2g.f               \  
                 $(SOURCE_CODE)/shap_filt_uv_s2c.f               \  
                 $(SOURCE_CODE)/shap_filt_uv_s4.f                \  
263    
264                                                                  \  #               $(SOURCE_CODE)/kpp_calc.f                       \
265    #               $(SOURCE_CODE)/kpp_calc_diff.f                  \
266    #               $(SOURCE_CODE)/kpp_calc_visc.f                  \
267    #               $(SOURCE_CODE)/kpp_do_diags.f                   \
268    #               $(SOURCE_CODE)/kpp_init.f                       \
269    #               $(SOURCE_CODE)/kpp_open_diags.f                 \
270    #               $(SOURCE_CODE)/kpp_routines.f                   \
271    #               $(SOURCE_CODE)/kpp_transport_s.f                \
272    #               $(SOURCE_CODE)/kpp_transport_t.f                \
273    #                                                               \
274    #               $(SOURCE_CODE)/shap_filt_apply_ts.f             \
275    #               $(SOURCE_CODE)/shap_filt_apply_uv.f             \
276    #               $(SOURCE_CODE)/shap_filt_tracer_s1.f            \
277    #               $(SOURCE_CODE)/shap_filt_tracer_s2.f            \
278    #               $(SOURCE_CODE)/shap_filt_tracer_s2g.f           \
279    #               $(SOURCE_CODE)/shap_filt_tracer_s4.f            \
280    #               $(SOURCE_CODE)/shap_filt_uv_s1.f                \
281    #               $(SOURCE_CODE)/shap_filt_uv_s2.f                \
282    #               $(SOURCE_CODE)/shap_filt_uv_s2g.f               \
283    #               $(SOURCE_CODE)/shap_filt_uv_s2c.f               \
284    #               $(SOURCE_CODE)/shap_filt_uv_s4.f                \
285    
286    #                                                               \
287  #               $(SOURCE_CODE)/ini_ep.f                         \  #               $(SOURCE_CODE)/ini_ep.f                         \
288  #               $(SOURCE_CODE)/calc_ep_forcing.f                \  #               $(SOURCE_CODE)/calc_ep_forcing.f                \
289  #               $(SOURCE_CODE)/cost_entropy.f                   \  #               $(SOURCE_CODE)/cost_entropy.f                   \
# Line 321  ftlchange: Line 335  ftlchange:
335             $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F_old ;          \             $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F_old ;          \
336          cat tamc_code_ftl.f >> $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F          cat tamc_code_ftl.f >> $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F
337    
338    bothchange:   adchange ftlchange
339    
340  adrestore:  adrestore:
341          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_template     \          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_template     \
342             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F
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