/[MITgcm]/MITgcm/adjoint/makefile
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revision 1.1 by heimbach, Sun Mar 25 22:33:51 2001 UTC revision 1.9 by heimbach, Mon Aug 13 18:12:02 2001 UTC
# Line 2  SHELL           = /bin/tcsh Line 2  SHELL           = /bin/tcsh
2  RM               = rm -f  RM               = rm -f
3  LOC              = $(PWD)  LOC              = $(PWD)
4  TAMC             = tamc  TAMC             = tamc
5    TAF              = ~fastopt/bin/taf
6  DEST             = .  DEST             = .
7  SOURCE_CODE      = ../bin  SOURCE_CODE      = ../bin
8  ADJOINT_SCRIPT   = ../adjoint  ADJOINT_SCRIPT   = ../adjoint
9  BASE             = ..  BASE             = ..
10  TAMCFLAGS        = -adjoint -i4 -r4  TAMCFLAGS        = -reverse -i4 -r4
11    TAFFLAGS         = -reverse -i4 -r4
12  PKG             = $(BASE)/pkg  PKG             = $(BASE)/pkg
13    
14  DIFF_FLAGS       = -module the_main_sens                \  DIFF_FLAGS       = -toplevel the_main_loop              \
15                     -input  '    xx_theta_dummy          \                     -input  '    xx_theta_dummy          \
16                                  xx_salt_dummy           \                                  xx_salt_dummy           \
17                                    xx_tr1_dummy            \
18                                  xx_hflux_dummy          \                                  xx_hflux_dummy          \
19                                  xx_sflux_dummy          \                                  xx_sflux_dummy          \
20                                  xx_tauu_dummy           \                                  xx_tauu_dummy           \
21                                  xx_tauv_dummy           \                                  xx_tauv_dummy           \
22                                  xx_sss_dummy            \                                  xx_sss_dummy            \
23                                  xx_sst_dummy'           \                                  xx_sst_dummy            \
24                                    xx_diffkr_dummy         \
25                                    xx_kapgm_dummy'         \
26                     -output 'fc'                     -output 'fc'
27    
28  TAMCFLAG         = $(TAMCFLAGS) $(DIFF_FLAGS) -l list_uv -admark ad  TAMCFLAG         = $(TAMCFLAGS) $(DIFF_FLAGS) -admark ad
29    
30    TAFFLAG          = $(TAFFLAGS) $(DIFF_FLAGS) -admark ad
31    
32    
33  # Source files for the MITgcmUV  # Source files for the MITgcmUV
34  SRC_MODEL       = $(PKG)/autodiff/read_write.flow       \  SRC_MODEL       = \
35                    $(PKG)/autodiff/read_write.flow \
36                  $(PKG)/autodiff/read_write_fld.flow     \                  $(PKG)/autodiff/read_write_fld.flow     \
37                  $(PKG)/autodiff/read_write_rec.flow     \                  $(PKG)/autodiff/read_write_rec.flow     \
                 $(PKG)/autodiff/cg2d.flow               \  
                 $(PKG)/autodiff/initialisation.flow     \  
38                  $(PKG)/autodiff/diags.flow              \                  $(PKG)/autodiff/diags.flow              \
39                    $(PKG)/autodiff/cg2d.flow               \
40                    $(PKG)/autodiff/debug.flow              \
41                  $(PKG)/autodiff/dummy_in_stepping.flow  \                  $(PKG)/autodiff/dummy_in_stepping.flow  \
42                  $(PKG)/autodiff/external_fields_load.flow       \                  $(PKG)/autodiff/external_fields_load.flow       \
43                  $(PKG)/autodiff/eesupp.flow             \                  $(PKG)/autodiff/eesupp.flow             \
44                  $(PKG)/autodiff/active_file.flow        \                  $(PKG)/autodiff/active_file.flow        \
45                  $(PKG)/autodiff/write_state.flow        \                  $(PKG)/autodiff/write_state.flow        \
46                  $(PKG)/autodiff/write_time_averages.flow\                  $(PKG)/autodiff/ecco_check_exp.flow     \
47                  $(PKG)/autodiff/exch_ad.flow            \                  $(PKG)/autodiff/exch_ad.flow            \
48                    $(PKG)/autodiff/exch_z_ad.flow          \
49                    $(PKG)/autodiff/exch_uv_ad.flow         \
50                  $(PKG)/autodiff/global_sum_ad.flow      \                  $(PKG)/autodiff/global_sum_ad.flow      \
51                  $(PKG)/autodiff/global_max_ad.flow      \                  $(PKG)/autodiff/global_max_ad.flow      \
52                    $(PKG)/autodiff/initialisation.flow     \
53                  $(PKG)/autodiff/mdsio.flow              \                  $(PKG)/autodiff/mdsio.flow              \
54                    $(PKG)/autodiff/monitor.flow            \
55                  $(PKG)/autodiff/checkpoint.flow         \                  $(PKG)/autodiff/checkpoint.flow         \
56                  $(PKG)/autodiff/print_message.flow      \                  $(PKG)/autodiff/print_message.flow      \
57                  $(PKG)/autodiff/open_copy_data_file.flow\                  $(PKG)/autodiff/open_copy_data_file.flow\
58                    $(PKG)/autodiff/timeave.flow            \
59                                                                  \                                                                  \
                 $(SOURCE_CODE)/grad_sigma.f                     \  
60                  $(SOURCE_CODE)/calc_buoyancy.f                  \                  $(SOURCE_CODE)/calc_buoyancy.f                  \
61                  $(SOURCE_CODE)/calc_common_factors.f            \                  $(SOURCE_CODE)/calc_common_factors.f            \
62                  $(SOURCE_CODE)/calc_diffusivity.f               \                  $(SOURCE_CODE)/calc_diffusivity.f               \
# Line 52  SRC_MODEL      = $(PKG)/autodiff/read_write.f Line 64  SRC_MODEL      = $(PKG)/autodiff/read_write.f
64                  $(SOURCE_CODE)/calc_grad_phi_surf.f             \                  $(SOURCE_CODE)/calc_grad_phi_surf.f             \
65                  $(SOURCE_CODE)/calc_gs.f                        \                  $(SOURCE_CODE)/calc_gs.f                        \
66                  $(SOURCE_CODE)/calc_gt.f                        \                  $(SOURCE_CODE)/calc_gt.f                        \
67                    $(SOURCE_CODE)/calc_gtr1.f                      \
68                  $(SOURCE_CODE)/calc_ivdc.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/calc_ivdc.f                      \
69                  $(SOURCE_CODE)/calc_mom_rhs.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/calc_mom_rhs.f                   \
70                  $(SOURCE_CODE)/calc_phi_hyd.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/calc_phi_hyd.f                   \
71                    $(SOURCE_CODE)/calc_viscosity.f                 \
72                  $(SOURCE_CODE)/comm_stats.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/comm_stats.f                     \
73                  $(SOURCE_CODE)/convect.f                        \                  $(SOURCE_CODE)/convect.f                        \
74                  $(SOURCE_CODE)/convective_adjustment.f          \                  $(SOURCE_CODE)/convective_adjustment.f          \
75                    $(SOURCE_CODE)/convective_adjustment_ini.f      \
76                  $(SOURCE_CODE)/correction_step.f                \                  $(SOURCE_CODE)/correction_step.f                \
77                  $(SOURCE_CODE)/cycle_tracer.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/cycle_tracer.f                   \
78                  $(SOURCE_CODE)/different_multiple.f             \                  $(SOURCE_CODE)/different_multiple.f             \
# Line 68  SRC_MODEL      = $(PKG)/autodiff/read_write.f Line 83  SRC_MODEL      = $(PKG)/autodiff/read_write.f
83                  $(SOURCE_CODE)/external_forcing_surf.f          \                  $(SOURCE_CODE)/external_forcing_surf.f          \
84                  $(SOURCE_CODE)/find_alpha.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/find_alpha.f                     \
85                  $(SOURCE_CODE)/find_rho.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/find_rho.f                       \
86                    $(SOURCE_CODE)/forward_step.f                   \
87                  $(SOURCE_CODE)/freeze.f                         \                  $(SOURCE_CODE)/freeze.f                         \
88                  $(SOURCE_CODE)/get_offline_fields.f             \                  $(SOURCE_CODE)/get_offline_fields.f             \
89                    $(SOURCE_CODE)/gad_biharm_x.f                   \
90                    $(SOURCE_CODE)/gad_biharm_y.f                   \
91                    $(SOURCE_CODE)/gad_c2_adv_r.f                   \
92                    $(SOURCE_CODE)/gad_c2_adv_x.f                   \
93                    $(SOURCE_CODE)/gad_c2_adv_y.f                   \
94                    $(SOURCE_CODE)/gad_c4_adv_r.f                   \
95                    $(SOURCE_CODE)/gad_c4_adv_x.f                   \
96                    $(SOURCE_CODE)/gad_c4_adv_y.f                   \
97                    $(SOURCE_CODE)/gad_calc_rhs.f                   \
98                    $(SOURCE_CODE)/gad_del2.f                       \
99                    $(SOURCE_CODE)/gad_diff_r.f                     \
100                    $(SOURCE_CODE)/gad_diff_x.f                     \
101                    $(SOURCE_CODE)/gad_diff_y.f                     \
102                    $(SOURCE_CODE)/gad_fluxlimit_adv_r.f            \
103                    $(SOURCE_CODE)/gad_fluxlimit_adv_x.f            \
104                    $(SOURCE_CODE)/gad_fluxlimit_adv_y.f            \
105                    $(SOURCE_CODE)/gad_grad_x.f                     \
106                    $(SOURCE_CODE)/gad_grad_y.f                     \
107                    $(SOURCE_CODE)/gad_u3_adv_r.f                   \
108                    $(SOURCE_CODE)/gad_u3_adv_x.f                   \
109                    $(SOURCE_CODE)/gad_u3_adv_y.f                   \
110                    $(SOURCE_CODE)/grad_sigma.f                     \
111                  $(SOURCE_CODE)/impldiff.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/impldiff.f                       \
112                  $(SOURCE_CODE)/ini_cartesian_grid.f             \                  $(SOURCE_CODE)/ini_cartesian_grid.f             \
113                  $(SOURCE_CODE)/ini_cg2d.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_cg2d.f                       \
114                  $(SOURCE_CODE)/ini_communication_patterns.f     \                  $(SOURCE_CODE)/ini_communication_patterns.f     \
115                  $(SOURCE_CODE)/ini_cori.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_cori.f                       \
116                    $(SOURCE_CODE)/ini_curvilinear_grid.f           \
117                  $(SOURCE_CODE)/ini_depths.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/ini_depths.f                     \
118                  $(SOURCE_CODE)/ini_fields.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/ini_fields.f                     \
119                  $(SOURCE_CODE)/ini_forcing.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/ini_forcing.f                    \
120                  $(SOURCE_CODE)/ini_grid.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_grid.f                       \
121                    $(SOURCE_CODE)/ini_linear_phisurf.f             \
122                  $(SOURCE_CODE)/ini_masks_etc.f                  \                  $(SOURCE_CODE)/ini_masks_etc.f                  \
123                    $(SOURCE_CODE)/ini_mixing.f                     \
124                    $(SOURCE_CODE)/ini_p_ground.f                   \
125                    $(SOURCE_CODE)/ini_pnh.f                        \
126                  $(SOURCE_CODE)/ini_procs.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/ini_procs.f                      \
127                  $(SOURCE_CODE)/ini_psurf.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/ini_psurf.f                      \
128                  $(SOURCE_CODE)/ini_salt.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_salt.f                       \
129                  $(SOURCE_CODE)/ini_spherical_polar_grid.f       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_spherical_polar_grid.f       \
130                  $(SOURCE_CODE)/ini_theta.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/ini_theta.f                      \
131                  $(SOURCE_CODE)/ini_uvel.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_tr1.f                        \
132                    $(SOURCE_CODE)/ini_dynvars.f                    \
133                    $(SOURCE_CODE)/ini_vel.f                        \
134                  $(SOURCE_CODE)/ini_vertical_grid.f              \                  $(SOURCE_CODE)/ini_vertical_grid.f              \
                 $(SOURCE_CODE)/ini_vvel.f                       \  
                 $(SOURCE_CODE)/ini_wvel.f                       \  
135                  $(SOURCE_CODE)/initialise_varia.f               \                  $(SOURCE_CODE)/initialise_varia.f               \
136                  $(SOURCE_CODE)/integrate_for_w.f                \                  $(SOURCE_CODE)/integrate_for_w.f                \
137                  $(SOURCE_CODE)/modeldata_example.f              \                  $(SOURCE_CODE)/modeldata_example.f              \
138                  $(SOURCE_CODE)/nml_filter.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_hfacz.f                 \
139                    $(SOURCE_CODE)/mom_calc_ke.f                    \
140                    $(SOURCE_CODE)/mom_cdscheme.f                   \
141                    $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_uu.f                   \
142                    $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_vu.f                   \
143                    $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_wu.f                   \
144                    $(SOURCE_CODE)/mom_u_bottomdrag.f               \
145                    $(SOURCE_CODE)/mom_u_del2u.f                    \
146                    $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_nh.f                \
147                    $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_sphere.f            \
148                    $(SOURCE_CODE)/mom_u_rviscflux.f                \
149                    $(SOURCE_CODE)/mom_u_sidedrag.f                 \
150                    $(SOURCE_CODE)/mom_u_xviscflux.f                \
151                    $(SOURCE_CODE)/mom_u_yviscflux.f                \
152                    $(SOURCE_CODE)/mom_v_adv_uv.f                   \
153                    $(SOURCE_CODE)/mom_v_adv_vv.f                   \
154                    $(SOURCE_CODE)/mom_v_adv_wv.f                   \
155                    $(SOURCE_CODE)/mom_v_bottomdrag.f               \
156                    $(SOURCE_CODE)/mom_v_del2v.f                    \
157                    $(SOURCE_CODE)/mom_v_metric_nh.f                \
158                    $(SOURCE_CODE)/mom_v_metric_sphere.f            \
159                    $(SOURCE_CODE)/mom_v_rviscflux.f                \
160                    $(SOURCE_CODE)/mom_v_sidedrag.f                 \
161                    $(SOURCE_CODE)/mom_v_xviscflux.f                \
162                    $(SOURCE_CODE)/mom_v_yviscflux.f                \
163                  $(SOURCE_CODE)/packages_init_variables.f        \                  $(SOURCE_CODE)/packages_init_variables.f        \
164                  $(SOURCE_CODE)/plot_field.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/plot_field.f                     \
165                  $(SOURCE_CODE)/solve_for_pressure.f             \                  $(SOURCE_CODE)/solve_for_pressure.f             \
166                  $(SOURCE_CODE)/state_summary.f                  \                  $(SOURCE_CODE)/state_summary.f                  \
167                  $(SOURCE_CODE)/timestep.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/timestep.f                       \
168                  $(SOURCE_CODE)/the_correction_step.f            \                  $(SOURCE_CODE)/the_correction_step.f            \
169                  $(SOURCE_CODE)/the_main_sens.f                  \                  $(SOURCE_CODE)/the_main_loop.f                  \
170                    $(SOURCE_CODE)/thermodynamics.f                 \
171                  $(SOURCE_CODE)/timestep_tracer.f                \                  $(SOURCE_CODE)/timestep_tracer.f                \
172                  $(SOURCE_CODE)/swfrac.f                         \                  $(SOURCE_CODE)/swfrac.f                         \
173                                                                  \                                                                  \
174                  $(SOURCE_CODE)/kpp_calc.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/kpp_calc.f                       \
175                  $(SOURCE_CODE)/kpp_calc_diff.f                  \                  $(SOURCE_CODE)/kpp_calc_diff.f                  \
176                    $(SOURCE_CODE)/kpp_calc_visc.f                  \
177                  $(SOURCE_CODE)/kpp_do_diags.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/kpp_do_diags.f                   \
178                  $(SOURCE_CODE)/kpp_init.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/kpp_init.f                       \
179                  $(SOURCE_CODE)/kpp_open_diags.f                 \                  $(SOURCE_CODE)/kpp_open_diags.f                 \
# Line 126  SRC_MODEL      = $(PKG)/autodiff/read_write.f Line 195  SRC_MODEL      = $(PKG)/autodiff/read_write.f
195                                                                  \                                                                  \
196                  $(SOURCE_CODE)/cost_final.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/cost_final.f                     \
197                  $(SOURCE_CODE)/cost_init.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/cost_init.f                      \
198                    $(SOURCE_CODE)/cost_tile.f                      \
199                  $(SOURCE_CODE)/cost_test.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/cost_test.f                      \
200                    $(SOURCE_CODE)/cost_tracer.f                    \
201                                                                  \                                                                  \
202    
203    
# Line 136  SRC_MODEL      = $(PKG)/autodiff/read_write.f Line 207  SRC_MODEL      = $(PKG)/autodiff/read_write.f
207    
208  adcode:  adcode:
209          cd $(DEST) ; cat $(SRC_MODEL) >! tamc_code_ecco.f          cd $(DEST) ; cat $(SRC_MODEL) >! tamc_code_ecco.f
210  admodel:  admodeltamc:
211          cd $(DEST) ; $(TAMC) $(TAMCFLAG) tamc_code_ecco.f       \          cd $(DEST) ; $(TAMC) $(TAMCFLAG) tamc_code_ecco.f       \
212             >! tamc_code_ecco.prot             >! tamc_code_ecco_ad.prot
213    
214    admodeltaf:
215            cd $(DEST) ; $(TAF) $(TAFFLAG) tamc_code_ecco.f
216    
217  adchange:  adchange:
218          ${ADJOINT_SCRIPT}/adjoint_ecco_sed.com \          ${ADJOINT_SCRIPT}/adjoint_ecco_sed.com \
# Line 149  adchange: Line 223  adchange:
223  adrestore:  adrestore:
224          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_template     \          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_template     \
225             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F
226  adall:  adcode admodel  
227    adtamc:  adcode admodeltamc
228    
229    adtaf:  adcode admodeltaf
Legend:
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